Protein–RNA interactions for Protein: Q12527

ATG11, Autophagy-related protein 11, yeastyeast

Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG11Q12527 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt3.11□□□□□ -1.91
ATG11Q12527 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt3.11□□□□□ -1.91
ATG11Q12527 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt3.11□□□□□ -1.91
ATG11Q12527 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt3.11□□□□□ -1.91
ATG11Q12527 YCL019WYCL019W 5313 nt3.11□□□□□ -1.91
ATG11Q12527 SLH1YGR271W 5904 nt3.1□□□□□ -1.91
ATG11Q12527 TOM70YNL121C 1854 nt3.1□□□□□ -1.91
ATG11Q12527 YFR056CYFR056C 369 nt3.1□□□□□ -1.91
ATG11Q12527 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt3.1□□□□□ -1.91
ATG11Q12527 RPL6AYML073C 531 nt3.1□□□□□ -1.91
ATG11Q12527 RPL20BYOR312C 519 nt3.1□□□□□ -1.91
ATG11Q12527 ILS1YBL076C 3219 nt3.1□□□□□ -1.91
ATG11Q12527 COX1Q0045 1605 nt3.1□□□□□ -1.91
ATG11Q12527 IRC23YOR044W 474 nt3.09□□□□□ -1.91
ATG11Q12527 EXO84YBR102C 2262 nt3.09□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 PDC2YDR081C 2778 nt3.08□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 CCT7YJL111W 1653 nt3.08□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 Q0032Q0032 291 nt3.08□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 RPL39YJL189W 156 nt3.08□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 TAF2YCR042C 4224 nt3.08□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 YIL169CYIL169C 2988 nt3.08□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 YNL034WYNL034W 1839 nt3.07□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 ROM1YGR070W 3468 nt3.07□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 YER023C-AYER023C-A 213 nt3.07□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 ISF1YMR081C 1017 nt3.07□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 YOR225WYOR225W 330 nt3.07□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 BOI1YBL085W 2943 nt3.07□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 FLO1YAR050W 4614 nt3.07□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 YBP1YBR216C 2025 nt3.07□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 FUN30YAL019W 3396 nt3.06□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 RPL26AYLR344W 384 nt3.06□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 YML037CYML037C 1023 nt3.06□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 DNA2YHR164C 4569 nt3.06□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 MOT1YPL082C 5604 nt3.06□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 TPS2YDR074W 2691 nt3.06□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 RIX1YHR197W 2292 nt3.05□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 PCF11YDR228C 1881 nt3.05□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt3.05□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 SPG3YDR504C 384 nt3.05□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt3.05□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 NCE101YJL205C 162 nt3.05□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 TMA10YLR327C 261 nt3.05□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 YBL073WYBL073W 312 nt3.05□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 RPL36BYPL249C-A 303 nt3.05□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 RRM3YHR031C 2172 nt3.05□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 SIP3YNL257C 3690 nt3.05□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 SSY1YDR160W 2559 nt3.04□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 AST2YER101C 1293 nt3.04□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt3.04□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt3.04□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt3.04□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt3.04□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt3.04□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt3.04□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 RPL9BYNL067W 576 nt3.04□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 YPL229WYPL229W 621 nt3.04□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 POM152YMR129W 4014 nt3.04□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 YMR31YFR049W 372 nt3.03□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 JLP2YMR132C 627 nt3.03□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 UBP14YBR058C 2346 nt3.03□□□□□ -1.92
ATG11Q12527 RAX2YLR084C 3663 nt3.03□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt3.02□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 NOT5YPR072W 1683 nt3.02□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 MET5YJR137C 4329 nt3.02□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 MSB2YGR014W 3921 nt3.02□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 VPS52YDR484W 1926 nt3.02□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt3.02□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 WIP1YDR374W-A 270 nt3.02□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 PSY1YKL076C 384 nt3.02□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt3.02□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 FCF2YLR051C 654 nt3.02□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt3.02□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 snR43snR43 209 nt3.02□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 GYP7YDL234C 2241 nt3.02□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 NUP82YJL061W 2142 nt3.02□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 BPT1YLL015W 4680 nt3.02□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 ECM5YMR176W 4236 nt3.01□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 YFL063WYFL063W 456 nt3.01□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 YIL058WYIL058W 285 nt3.01□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 FUS1YCL027W 1539 nt3.01□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 YAT2YER024W 2772 nt3.01□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 COG3YER157W 2406 nt3.01□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 PMR1YGL167C 2853 nt3.01□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 YJL016WYJL016W 1686 nt3.01□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 NPR1YNL183C 2373 nt3.01□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 YOL057WYOL057W 2136 nt3.01□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 GCD6YDR211W 2139 nt3□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 DYN2YDR424C 279 nt3□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 RPL33AYPL143W 324 nt3□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt3□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 SEC7YDR170C 6030 nt2.99□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 TSC11YER093C 4293 nt2.99□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 PSK1YAL017W 4071 nt2.99□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 KAP104YBR017C 2757 nt2.99□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 YPK1YKL126W 2043 nt2.99□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 YDL041WYDL041W 354 nt2.99□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 ESF2YNR054C 951 nt2.99□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 YPL216WYPL216W 3309 nt2.99□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 ATG13YPR185W 2217 nt2.99□□□□□ -1.93
ATG11Q12527 YLR278CYLR278C 4026 nt2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 129.5 ms