Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 YDR250CYDR250C 276 nt2.67□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.67□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 YIL174WYIL174W 228 nt2.67□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.67□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 RPL20AYMR242C 519 nt2.67□□□□□ -1.98 RIP-Chip
PUF2Q12221 SIN3YOL004W 4611 nt2.67□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 DPB11YJL090C 2295 nt2.67□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 BUB1YGR188C 3066 nt2.67□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 MET6YER091C 2304 nt2.67□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 APC11YDL008W 498 nt2.66□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 NOP19YGR251W 591 nt2.66□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 YJR023CYJR023C 402 nt2.66□□□□□ -1.98 RIP-Chip
PUF2Q12221 RPL37AYLR185W 267 nt2.66□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 MOT1YPL082C 5604 nt2.66□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 SWT1YOR166C 1377 nt2.65□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 YPR203WYPR203W 309 nt2.65□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 snR43snR43 209 nt2.65□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 ECM29YHL030W 5607 nt2.65□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 GCD10YNL062C 1437 nt2.65□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 BCK1YJL095W 4437 nt2.64□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 snR70snR70 164 nt2.64□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 YDR102CYDR102C 333 nt2.64□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 IRC4YDR540C 540 nt2.64□□□□□ -1.99 RIP-Chip
PUF2Q12221 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.64□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 RPL14BYHL001W 417 nt2.64□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 RPC10YHR143W-A 213 nt2.64□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 ISU1YPL135W 498 nt2.64□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 OST1YJL002C 1431 nt2.64□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 YOL057WYOL057W 2136 nt2.63□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 JSN1YJR091C 3276 nt2.63□□□□□ -1.99 RIP-Chip
PUF2Q12221 DBP7YKR024C 2229 nt2.63□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 HMRA2YCR096C 360 nt2.63□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 GPI8YDR331W 1236 nt2.63□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 TIF35YDR429C 825 nt2.63□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.63□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.63□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.63□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 YAR029WYAR029W 225 nt2.63□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 YBL108WYBL108W 306 nt2.63□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 ESL1YIL151C 3357 nt2.63□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 PDR1YGL013C 3207 nt2.63□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 SEC26YDR238C 2922 nt2.63□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 NEW1YPL226W 3591 nt2.62□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 BNA4YBL098W 1383 nt2.62□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 CWC22YGR278W 1734 nt2.62□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 PTP3YER075C 2787 nt2.62□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 snR8snR8 190 nt2.62□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 YMR31YFR049W 372 nt2.62□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 YKL111CYKL111C 336 nt2.62□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 TIM18YOR297C 579 nt2.62□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 YPL238CYPL238C 390 nt2.62□□□□□ -1.99 RIP-Chip
PUF2Q12221 ROX1YPR065W 1107 nt2.62□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 SKT5YBL061C 2091 nt2.62□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 CDC20YGL116W 1833 nt2.61□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 YSW1YBR148W 1830 nt2.61□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 ESL2YKR096W 3588 nt2.61□□□□□ -1.99 RIP-Chip
PUF2Q12221 CAF120YNL278W 3183 nt2.61□□□□□ -1.99 RIP-Chip
PUF2Q12221 TIM11YDR322C-A 291 nt2.61□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 TSA2YDR453C 591 nt2.61□□□□□ -1.99 RIP-Chip
PUF2Q12221 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.61□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 PNC1YGL037C 651 nt2.61□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.61□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 MCM22YJR135C 720 nt2.61□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 BIL1YOR304C-A 231 nt2.61□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 GIN4YDR507C 3429 nt2.61□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 RTT10YPL183C 3042 nt2.6□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 HPA3YEL066W 540 nt2.6□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 YFL032WYFL032W 321 nt2.6□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.6□□□□□ -1.99 RIP-Chip
PUF2Q12221 INP52YNL106C 3552 nt2.6□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 SIP3YNL257C 3690 nt2.6□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 RIF1YBR275C 5751 nt2.6□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 MMS1YPR164W 4224 nt2.6□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 PDR3YBL005W 2931 nt2.59□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 COG3YER157W 2406 nt2.59□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 TOM1YDR457W 9807 nt2.59□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 SNX41YDR425W 1878 nt2.59□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 HOP2YGL033W 657 nt2.59□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt2.59□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.59□□□□□ -1.99
PUF2Q12221 FLO11YIR019C 4104 nt2.58□□□□□ -2
PUF2Q12221 NDD1YOR372C 1665 nt2.58□□□□□ -2 RIP-Chip
PUF2Q12221 RPL39YJL189W 156 nt2.58□□□□□ -2
PUF2Q12221 EMC6YLL014W 327 nt2.58□□□□□ -2
PUF2Q12221 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt2.58□□□□□ -2
PUF2Q12221 YDR186CYDR186C 2634 nt2.58□□□□□ -2
PUF2Q12221 FKS3YMR306W 5358 nt2.57□□□□□ -2
PUF2Q12221 RPO41YFL036W 4056 nt2.57□□□□□ -2
PUF2Q12221 NPR1YNL183C 2373 nt2.57□□□□□ -2
PUF2Q12221 URM1YIL008W 300 nt2.57□□□□□ -2 RIP-Chip
PUF2Q12221 YJL202CYJL202C 348 nt2.57□□□□□ -2
PUF2Q12221 SHE2YKL130C 741 nt2.57□□□□□ -2
PUF2Q12221 AIM32YML050W 936 nt2.57□□□□□ -2
PUF2Q12221 YOR050CYOR050C 348 nt2.57□□□□□ -2
PUF2Q12221 SAP1YER047C 2694 nt2.57□□□□□ -2 RIP-Chip
PUF2Q12221 STE5YDR103W 2754 nt2.57□□□□□ -2
PUF2Q12221 FUS1YCL027W 1539 nt2.57□□□□□ -2
PUF2Q12221 POM152YMR129W 4014 nt2.57□□□□□ -2 RIP-Chip
PUF2Q12221 APC2YLR127C 2562 nt2.56□□□□□ -2
PUF2Q12221 DUG2YBR281C 2637 nt2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 50.4 ms