Protein–RNA interactions for Protein: Q12158

MCD1, Sister chromatid cohesion protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MCD1Q12158 RIX1YHR197W 2292 nt3.45□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 TCP1YDR212W 1680 nt3.44□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 RPL35AYDL191W 363 nt3.44□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 YGL149WYGL149W 306 nt3.44□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 RAM2YKL019W 951 nt3.44□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 RPL8BYLL045C 771 nt3.44□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.44□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.44□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.44□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.44□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 YMR324CYMR324C 243 nt3.44□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 HCH1YNL281W 462 nt3.44□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.44□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 ASG1YIL130W 2895 nt3.44□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 TAF1YGR274C 3201 nt3.44□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 AIM9YER080W 1884 nt3.43□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 YGR265WYGR265W 411 nt3.43□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 YKR033CYKR033C 426 nt3.43□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 BCH1YMR237W 2175 nt3.43□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 STE23YLR389C 3084 nt3.42□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 CSN9YDR179C 489 nt3.42□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 YDR193WYDR193W 399 nt3.42□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 YER189WYER189W 369 nt3.42□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt3.42□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 HSK3YKL138C-A 210 nt3.42□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 RPS8AYBL072C 603 nt3.42□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 RPL25YOL127W 429 nt3.42□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 TRM2YKR056W 1920 nt3.42□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 PUF4YGL014W 2667 nt3.42□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 ITC1YGL133W 3795 nt3.41□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 ANB1YJR047C 474 nt3.41□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 OSH6YKR003W 1347 nt3.41□□□□□ -1.86
MCD1Q12158 YGL239CYGL239C 315 nt3.4□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 ENA5YDR038C 3276 nt3.39□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 ENA2YDR039C 3276 nt3.39□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 ENA1YDR040C 3276 nt3.39□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 RPA135YPR010C 3612 nt3.39□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.39□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.39□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 PSK2YOL045W 3306 nt3.39□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 BMS1YPL217C 3552 nt3.39□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 GIS4YML006C 2325 nt3.38□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 SOK1YDR006C 2706 nt3.38□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.38□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt3.38□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 TIM13YGR181W 318 nt3.38□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 RPL32YBL092W 393 nt3.38□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 MAK21YDR060W 3078 nt3.38□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 JIP5YPR169W 1479 nt3.37□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 HTL1YCR020W-B 237 nt3.37□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 snR80snR80 171 nt3.37□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 BLI1YKL061W 342 nt3.37□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 SHH3YMR118C 591 nt3.37□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 YPR099CYPR099C 357 nt3.37□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt3.37□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 PUF6YDR496C 1971 nt3.37□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 AKR1YDR264C 2295 nt3.37□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 LYS9YNR050C 1341 nt3.37□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 PAC1YOR269W 1485 nt3.36□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 YDR344CYDR344C 444 nt3.36□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 LSO2YGR169C-A 279 nt3.36□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 GIN4YDR507C 3429 nt3.35□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 YER079C-AYER079C-A 339 nt3.35□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 YBR197CYBR197C 654 nt3.35□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 AI2Q0055 2565 nt3.35□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 VTC4YJL012C 2166 nt3.34□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 TAF2YCR042C 4224 nt3.34□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 QCR7YDR529C 384 nt3.34□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 FMP32YFL046W 624 nt3.34□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 YGR069WYGR069W 336 nt3.34□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 VAS1YGR094W 3315 nt3.34□□□□□ -1.87
MCD1Q12158 NUP120YKL057C 3114 nt3.34□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 KAR3YPR141C 2190 nt3.34□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 AUS1YOR011W 4185 nt3.33□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 PSY2YNL201C 2577 nt3.33□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 DUF1YOL087C 3351 nt3.33□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 MTC3YGL226W 372 nt3.33□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 RPL22AYLR061W 366 nt3.33□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 HTB2YBL002W 396 nt3.33□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 RGM1YMR182C 636 nt3.33□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 YNL010WYNL010W 726 nt3.33□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 IPT1YDR072C 1584 nt3.33□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 GCD6YDR211W 2139 nt3.32□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 BAS1YKR099W 2436 nt3.32□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 YJL070CYJL070C 2667 nt3.32□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 DIS3YOL021C 3006 nt3.32□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 DSE4YNR067C 3354 nt3.32□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 CDC20YGL116W 1833 nt3.31□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 FAP7YDL166C 594 nt3.31□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 YDR048CYDR048C 315 nt3.31□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 ALG13YGL047W 609 nt3.31□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt3.31□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.31□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt3.31□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 RPL36BYPL249C-A 303 nt3.31□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 SAK1YER129W 3429 nt3.31□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 RPA190YOR341W 4995 nt3.31□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 snR76snR76 109 nt3.3□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 YDL211CYDL211C 1119 nt3.3□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 PSF1YDR013W 627 nt3.3□□□□□ -1.88
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