Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 RPI1YIL119C 1224 nt2.5□□□□□ -2.01
HEF3P53978 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt2.5□□□□□ -2.01
HEF3P53978 RPS29AYLR388W 171 nt2.5□□□□□ -2.01
HEF3P53978 NOP15YNL110C 663 nt2.5□□□□□ -2.01
HEF3P53978 SMY2YBR172C 2223 nt2.5□□□□□ -2.01
HEF3P53978 FAR11YNL127W 2862 nt2.5□□□□□ -2.01
HEF3P53978 ECM5YMR176W 4236 nt2.5□□□□□ -2.01
HEF3P53978 GPI17YDR434W 1605 nt2.5□□□□□ -2.01
HEF3P53978 IRC4YDR540C 540 nt2.49□□□□□ -2.01
HEF3P53978 YER084W-AYER084W-A 513 nt2.49□□□□□ -2.01
HEF3P53978 BIG1YHR101C 1008 nt2.49□□□□□ -2.01
HEF3P53978 PKR1YMR123W 369 nt2.49□□□□□ -2.01
HEF3P53978 TOM22YNL131W 459 nt2.49□□□□□ -2.01
HEF3P53978 IRC16YPR038W 360 nt2.49□□□□□ -2.01
HEF3P53978 YPR177CYPR177C 372 nt2.49□□□□□ -2.01
HEF3P53978 SCH9YHR205W 2475 nt2.49□□□□□ -2.01
HEF3P53978 MGM1YOR211C 2646 nt2.49□□□□□ -2.01
HEF3P53978 YIL080WYIL080W 4722 nt2.49□□□□□ -2.01
HEF3P53978 snR76snR76 109 nt2.48□□□□□ -2.01
HEF3P53978 GLC7YER133W 939 nt2.48□□□□□ -2.01
HEF3P53978 NOP19YGR251W 591 nt2.48□□□□□ -2.01
HEF3P53978 LAG1YHL003C 1236 nt2.48□□□□□ -2.01
HEF3P53978 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.48□□□□□ -2.01
HEF3P53978 YLR255CYLR255C 354 nt2.48□□□□□ -2.01
HEF3P53978 KRE33YNL132W 3171 nt2.48□□□□□ -2.01
HEF3P53978 DPB11YJL090C 2295 nt2.48□□□□□ -2.01
HEF3P53978 YKU80YMR106C 1890 nt2.48□□□□□ -2.01
HEF3P53978 SAK1YER129W 3429 nt2.47□□□□□ -2.01
HEF3P53978 SIR3YLR442C 2937 nt2.47□□□□□ -2.01
HEF3P53978 SMB1YER029C 591 nt2.47□□□□□ -2.01
HEF3P53978 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.47□□□□□ -2.01
HEF3P53978 YFL019CYFL019C 354 nt2.47□□□□□ -2.01
HEF3P53978 RNR4YGR180C 1038 nt2.47□□□□□ -2.01
HEF3P53978 YJR023CYJR023C 402 nt2.47□□□□□ -2.01
HEF3P53978 YKL202WYKL202W 582 nt2.47□□□□□ -2.01
HEF3P53978 LCL2YLR104W 396 nt2.47□□□□□ -2.01
HEF3P53978 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt2.47□□□□□ -2.01
HEF3P53978 RPS1AYLR441C 768 nt2.47□□□□□ -2.01
HEF3P53978 ATP3YBR039W 936 nt2.47□□□□□ -2.01
HEF3P53978 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.47□□□□□ -2.01
HEF3P53978 TPS2YDR074W 2691 nt2.47□□□□□ -2.01
HEF3P53978 ORC2YBR060C 1863 nt2.47□□□□□ -2.01
HEF3P53978 NDD1YOR372C 1665 nt2.47□□□□□ -2.01
HEF3P53978 BAS1YKR099W 2436 nt2.46□□□□□ -2.02
HEF3P53978 YBT1YLL048C 4986 nt2.46□□□□□ -2.02
HEF3P53978 YPS5YGL259W 498 nt2.46□□□□□ -2.02
HEF3P53978 RPL37AYLR185W 267 nt2.46□□□□□ -2.02
HEF3P53978 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.46□□□□□ -2.02
HEF3P53978 RGM1YMR182C 636 nt2.46□□□□□ -2.02
HEF3P53978 PEP8YJL053W 1140 nt2.45□□□□□ -2.02
HEF3P53978 CMS1YLR003C 876 nt2.45□□□□□ -2.02
HEF3P53978 RMP1YLR145W 606 nt2.45□□□□□ -2.02
HEF3P53978 YML108WYML108W 318 nt2.45□□□□□ -2.02
HEF3P53978 RRT1YBL048W 312 nt2.45□□□□□ -2.02
HEF3P53978 YOL134CYOL134C 390 nt2.45□□□□□ -2.02
HEF3P53978 YPL197CYPL197C 414 nt2.45□□□□□ -2.02
HEF3P53978 RPB5YBR154C 648 nt2.45□□□□□ -2.02
HEF3P53978 snR41snR41 95 nt2.45□□□□□ -2.02
HEF3P53978 STH1YIL126W 4080 nt2.45□□□□□ -2.02
HEF3P53978 MUD2YKL074C 1584 nt2.44□□□□□ -2.02
HEF3P53978 SPE1YKL184W 1401 nt2.44□□□□□ -2.02
HEF3P53978 IRA2YOL081W 9240 nt2.44□□□□□ -2.02
HEF3P53978 YGR042WYGR042W 816 nt2.44□□□□□ -2.02
HEF3P53978 ECL1YGR146C 636 nt2.44□□□□□ -2.02
HEF3P53978 YIL058WYIL058W 285 nt2.44□□□□□ -2.02
HEF3P53978 TPM2YIL138C 486 nt2.44□□□□□ -2.02
HEF3P53978 AIM29YKR074W 468 nt2.44□□□□□ -2.02
HEF3P53978 YNL324WYNL324W 396 nt2.44□□□□□ -2.02
HEF3P53978 RPB11YOL005C 363 nt2.44□□□□□ -2.02
HEF3P53978 TRM7YBR061C 933 nt2.44□□□□□ -2.02
HEF3P53978 SDC25YLL016W 3147 nt2.44□□□□□ -2.02
HEF3P53978 ROY1YMR258C 1662 nt2.44□□□□□ -2.02
HEF3P53978 PSD2YGR170W 3417 nt2.43□□□□□ -2.02
HEF3P53978 MDM32YOR147W 1869 nt2.43□□□□□ -2.02
HEF3P53978 PSO2YMR137C 1986 nt2.43□□□□□ -2.02
HEF3P53978 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.43□□□□□ -2.02
HEF3P53978 ECM25YJL201W 1800 nt2.43□□□□□ -2.02
HEF3P53978 RPL25YOL127W 429 nt2.43□□□□□ -2.02
HEF3P53978 PHO2YDL106C 1680 nt2.42□□□□□ -2.02
HEF3P53978 GPI8YDR331W 1236 nt2.42□□□□□ -2.02
HEF3P53978 URA10YMR271C 684 nt2.42□□□□□ -2.02
HEF3P53978 SET2YJL168C 2202 nt2.42□□□□□ -2.02
HEF3P53978 GDS1YOR355W 1569 nt2.41□□□□□ -2.02
HEF3P53978 RGA2YDR379W 3030 nt2.41□□□□□ -2.02
HEF3P53978 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.41□□□□□ -2.02
HEF3P53978 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.41□□□□□ -2.02
HEF3P53978 YGL165CYGL165C 579 nt2.41□□□□□ -2.02
HEF3P53978 HYR1YIR037W 492 nt2.41□□□□□ -2.02
HEF3P53978 YJR079WYJR079W 330 nt2.41□□□□□ -2.02
HEF3P53978 CRS5YOR031W 210 nt2.41□□□□□ -2.02
HEF3P53978 YBR197CYBR197C 654 nt2.41□□□□□ -2.02
HEF3P53978 DAD3YBR233W-A 285 nt2.41□□□□□ -2.02
HEF3P53978 CSF1YLR087C 8877 nt2.41□□□□□ -2.02
HEF3P53978 YPK1YKL126W 2043 nt2.41□□□□□ -2.02
HEF3P53978 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.4□□□□□ -2.03
HEF3P53978 RPS7BYNL096C 573 nt2.4□□□□□ -2.03
HEF3P53978 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.4□□□□□ -2.03
HEF3P53978 snR54snR54 86 nt2.4□□□□□ -2.03
HEF3P53978 PPN1YDR452W 2025 nt2.4□□□□□ -2.03
HEF3P53978 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.39□□□□□ -2.03
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