Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 RRP17YDR412W 708 nt8.41□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 PUS2YGL063W 1113 nt8.41□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 AHT1YHR093W 549 nt8.41□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 MAS1YLR163C 1389 nt8.4□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 NBP35YGL091C 987 nt8.4□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 JJJ3YJR097W 519 nt8.4□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 YLR179CYLR179C 606 nt8.4□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 TIM23YNR017W 669 nt8.4□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 IDI1YPL117C 867 nt8.4□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 COQ8YGL119W 1506 nt8.39□□□□□ -1.07
TY1A-DR3Q12441 SPR1YOR190W 1338 nt8.39□□□□□ -1.07
TY1A-DR3Q12441 YHR145CYHR145C 357 nt8.39□□□□□ -1.07
TY1A-DR3Q12441 POS5YPL188W 1245 nt8.39□□□□□ -1.07
TY1A-DR3Q12441 SWC5YBR231C 912 nt8.39□□□□□ -1.07
TY1A-DR3Q12441 YNL115CYNL115C 1935 nt8.39□□□□□ -1.07
TY1A-DR3Q12441 YKR104WYKR104W 921 nt8.38□□□□□ -1.07
TY1A-DR3Q12441 MRPL24YMR193W 777 nt8.38□□□□□ -1.07
TY1A-DR3Q12441 UBS1YBR165W 834 nt8.38□□□□□ -1.07
TY1A-DR3Q12441 TRP4YDR354W 1143 nt8.37□□□□□ -1.07
TY1A-DR3Q12441 PTH1YHR189W 573 nt8.37□□□□□ -1.07
TY1A-DR3Q12441 OMA1YKR087C 1038 nt8.37□□□□□ -1.07
TY1A-DR3Q12441 HAT1YPL001W 1125 nt8.37□□□□□ -1.07
TY1A-DR3Q12441 PEX25YPL112C 1185 nt8.36□□□□□ -1.07
TY1A-DR3Q12441 NUF2YOL069W 1356 nt8.35□□□□□ -1.07
TY1A-DR3Q12441 EDC1YGL222C 528 nt8.35□□□□□ -1.07
TY1A-DR3Q12441 PCL1YNL289W 840 nt8.35□□□□□ -1.07
TY1A-DR3Q12441 TSR3YOR006C 942 nt8.35□□□□□ -1.07
TY1A-DR3Q12441 ARO8YGL202W 1503 nt8.34□□□□□ -1.07
TY1A-DR3Q12441 ERG12YMR208W 1332 nt8.34□□□□□ -1.07
TY1A-DR3Q12441 FSH1YHR049W 732 nt8.34□□□□□ -1.07
TY1A-DR3Q12441 OAZ1YPL052W 879 nt8.34□□□□□ -1.07
TY1A-DR3Q12441 HIS2YFR025C 1008 nt8.33□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 MER1YNL210W 813 nt8.33□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 YOL079WYOL079W 399 nt8.33□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 TAF11YML015C 1041 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 MRPS8YMR158W 468 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 RCE1YMR274C 948 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 MCT1YOR221C 1083 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 TFB4YPR056W 1017 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 MGR3YMR115W 1506 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 PUS9YDL036C 1389 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 ZAP1YJL056C 2643 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 SRL2YLR082C 1179 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 GFD1YMR255W 567 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 YNL228WYNL228W 777 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 YDR306CYDR306C 1437 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 SHM2YLR058C 1410 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 SGA1YIL099W 1650 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 CLB5YPR120C 1308 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 PSD1YNL169C 1503 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 YNR048WYNR048W 1182 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 YBR292CYBR292C 372 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 BUD31YCR063W 474 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 PCL6YER059W 1263 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 DAT1YML113W 747 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 RRS1YOR294W 612 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 HAS1YMR290C 1518 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 RSC8YFR037C 1674 nt8.27□□□□□ -1.08
TY1A-DR3Q12441 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt8.27□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 LSB6YJL100W 1824 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 MED2YDL005C 1296 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 NIT1YIL164C 600 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 AIM2YAL049C 741 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 OPI10YOL032W 741 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 IRC14YOR135C 342 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 SSP2YOR242C 1116 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 YPL277CYPL277C 1464 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 KES1YPL145C 1305 nt8.25□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 EHD3YDR036C 1503 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 DBP1YPL119C 1854 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 BSP1YPR171W 1731 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 ENT5YDR153C 1236 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 YEA4YEL004W 1029 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 YGR168CYGR168C 1131 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 ADD66YKL206C 804 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 ERV41YML067C 1059 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 YET2YMR040W 483 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 DCP1YOL149W 696 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 MMS2YGL087C 414 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 SHY1YGR112W 1170 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 DAL2YIR029W 1032 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 ISY1YJR050W 708 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 YLR235CYLR235C 399 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 MCM5YLR274W 2328 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 YBR138CYBR138C 1575 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 SAS4YDR181C 1446 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 SKI6YGR195W 741 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 LIP1YMR298W 453 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 GID7YCL039W 2238 nt8.21□□□□□ -1.09
TY1A-DR3Q12441 KRE28YDR532C 1158 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-DR3Q12441 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-DR3Q12441 IMT4tM(CAU)E 72 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-DR3Q12441 IMT3tM(CAU)J3 72 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-DR3Q12441 IMT1tM(CAU)O1 72 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-DR3Q12441 IMT2tM(CAU)P 72 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-DR3Q12441 BET2YPR176C 978 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-DR3Q12441 GAP1YKR039W 1809 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-DR3Q12441 DMA2YNL116W 1569 nt8.21□□□□□ -1.1
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