Protein–RNA interactions for Protein: Q12329

HSP42, Heat shock protein 42, yeastyeast

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HSP42Q12329 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.52□□□□□ -1.05
HSP42Q12329 UFO1YML088W 2007 nt8.52□□□□□ -1.05
HSP42Q12329 LIP1YMR298W 453 nt8.51□□□□□ -1.05
HSP42Q12329 YJL064WYJL064W 396 nt8.5□□□□□ -1.05
HSP42Q12329 ECM27YJR106W 2178 nt8.5□□□□□ -1.05
HSP42Q12329 YBR232CYBR232C 360 nt8.5□□□□□ -1.05
HSP42Q12329 LPD1YFL018C 1500 nt8.49□□□□□ -1.05
HSP42Q12329 GID8YMR135C 1368 nt8.48□□□□□ -1.05
HSP42Q12329 AAC3YBR085W 924 nt8.48□□□□□ -1.05
HSP42Q12329 PET8YNL003C 855 nt8.47□□□□□ -1.05
HSP42Q12329 OYE3YPL171C 1203 nt8.47□□□□□ -1.05
HSP42Q12329 DIG1YPL049C 1359 nt8.47□□□□□ -1.05
HSP42Q12329 CCT5YJR064W 1689 nt8.46□□□□□ -1.05
HSP42Q12329 MDM35YKL053C-A 261 nt8.46□□□□□ -1.06
HSP42Q12329 TAF13YML098W 504 nt8.46□□□□□ -1.06
HSP42Q12329 ACH1YBL015W 1581 nt8.46□□□□□ -1.06
HSP42Q12329 MRS6YOR370C 1812 nt8.45□□□□□ -1.06
HSP42Q12329 PAU19YMR325W 375 nt8.44□□□□□ -1.06
HSP42Q12329 SPP2YOR148C 558 nt8.44□□□□□ -1.06
HSP42Q12329 LSB5YCL034W 1065 nt8.44□□□□□ -1.06
HSP42Q12329 TIM44YIL022W 1296 nt8.43□□□□□ -1.06
HSP42Q12329 YKL133CYKL133C 1392 nt8.43□□□□□ -1.06
HSP42Q12329 LEU9YOR108W 1815 nt8.43□□□□□ -1.06
HSP42Q12329 MEX67YPL169C 1800 nt8.42□□□□□ -1.06
HSP42Q12329 YRF1-2YER190W 5046 nt8.41□□□□□ -1.06
HSP42Q12329 YDL086WYDL086W 822 nt8.41□□□□□ -1.06
HSP42Q12329 SLG1YOR008C 1137 nt8.41□□□□□ -1.06
HSP42Q12329 FMS1YMR020W 1527 nt8.4□□□□□ -1.06
HSP42Q12329 TOA2YKL058W 369 nt8.4□□□□□ -1.06
HSP42Q12329 YMR103CYMR103C 363 nt8.4□□□□□ -1.06
HSP42Q12329 NUC1YJL208C 990 nt8.39□□□□□ -1.07
HSP42Q12329 PHO23YNL097C 993 nt8.39□□□□□ -1.07
HSP42Q12329 NBA1YOL070C 1506 nt8.39□□□□□ -1.07
HSP42Q12329 BRR1YPR057W 1026 nt8.38□□□□□ -1.07
HSP42Q12329 CSM1YCR086W 573 nt8.37□□□□□ -1.07
HSP42Q12329 RIB7YBR153W 735 nt8.37□□□□□ -1.07
HSP42Q12329 YHR131CYHR131C 2553 nt8.36□□□□□ -1.07
HSP42Q12329 YPL251WYPL251W 303 nt8.36□□□□□ -1.07
HSP42Q12329 TIP1YBR067C 633 nt8.36□□□□□ -1.07
HSP42Q12329 RPT5YOR117W 1305 nt8.35□□□□□ -1.07
HSP42Q12329 YJL118WYJL118W 660 nt8.35□□□□□ -1.07
HSP42Q12329 CWP2YKL096W-A 279 nt8.35□□□□□ -1.07
HSP42Q12329 YHR219WYHR219W 1875 nt8.34□□□□□ -1.07
HSP42Q12329 GND2YGR256W 1479 nt8.34□□□□□ -1.07
HSP42Q12329 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.34□□□□□ -1.07
HSP42Q12329 YMR262WYMR262W 942 nt8.34□□□□□ -1.07
HSP42Q12329 YJR114WYJR114W 393 nt8.33□□□□□ -1.08
HSP42Q12329 AGP3YFL055W 1677 nt8.33□□□□□ -1.08
HSP42Q12329 YPS3YLR121C 1527 nt8.33□□□□□ -1.08
HSP42Q12329 MET1YKR069W 1782 nt8.33□□□□□ -1.08
HSP42Q12329 GAL3YDR009W 1563 nt8.32□□□□□ -1.08
HSP42Q12329 PAR32YDL173W 888 nt8.32□□□□□ -1.08
HSP42Q12329 RIB1YBL033C 1038 nt8.32□□□□□ -1.08
HSP42Q12329 LSR1LSR1 1175 nt8.32□□□□□ -1.08
HSP42Q12329 NDE1YMR145C 1683 nt8.32□□□□□ -1.08
HSP42Q12329 CCR4YAL021C 2514 nt8.31□□□□□ -1.08
HSP42Q12329 FLR1YBR008C 1647 nt8.3□□□□□ -1.08
HSP42Q12329 SAM2YDR502C 1155 nt8.29□□□□□ -1.08
HSP42Q12329 SOD2YHR008C 702 nt8.29□□□□□ -1.08
HSP42Q12329 POT1YIL160C 1254 nt8.29□□□□□ -1.08
HSP42Q12329 BNI5YNL166C 1347 nt8.28□□□□□ -1.08
HSP42Q12329 YJR154WYJR154W 1041 nt8.27□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 ERG6YML008C 1152 nt8.27□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 GSF2YML048W 1212 nt8.27□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 SMC5YOL034W 3282 nt8.27□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 TUB4YLR212C 1422 nt8.27□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 YIA6YIL006W 1122 nt8.26□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 MHF1YOL086W-A 273 nt8.26□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 UFD1YGR048W 1086 nt8.25□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 SNZ1YMR096W 894 nt8.25□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 CMK2YOL016C 1344 nt8.25□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 DLD2YDL178W 1593 nt8.24□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 RAS2YNL098C 969 nt8.24□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 MIM1YOL026C 342 nt8.24□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 RPD3YNL330C 1302 nt8.24□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 DAK2YFL053W 1776 nt8.23□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.23□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.23□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.23□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.23□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.23□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.23□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.23□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.23□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.23□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.23□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.23□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.23□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.23□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.23□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.23□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 TPS1YBR126C 1488 nt8.22□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 CTI6YPL181W 1521 nt8.22□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 CRN1YLR429W 1956 nt8.22□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 SAM3YPL274W 1764 nt8.22□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 SEC61YLR378C 1443 nt8.21□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 DLD3YEL071W 1491 nt8.21□□□□□ -1.09
HSP42Q12329 MGM101YJR144W 810 nt8.21□□□□□ -1.1
HSP42Q12329 IML3YBR107C 738 nt8.21□□□□□ -1.1
HSP42Q12329 MSC1YML128C 1542 nt8.2□□□□□ -1.1
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