Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 SPS100YHR139C 981 nt10.02□□□□□ -0.81
CLF1Q12309 PUP1YOR157C 786 nt10.02□□□□□ -0.81
CLF1Q12309 GAL2YLR081W 1725 nt10□□□□□ -0.81
CLF1Q12309 YDR455CYDR455C 309 nt10□□□□□ -0.81
CLF1Q12309 PAU19YMR325W 375 nt10□□□□□ -0.81
CLF1Q12309 KRE1YNL322C 942 nt10□□□□□ -0.81
CLF1Q12309 TOK1YJL093C 2076 nt10□□□□□ -0.81
CLF1Q12309 APS2YJR058C 444 nt9.99□□□□□ -0.81
CLF1Q12309 ERG13YML126C 1476 nt9.98□□□□□ -0.81
CLF1Q12309 RRT8YOL048C 1029 nt9.98□□□□□ -0.81
CLF1Q12309 URA8YJR103W 1737 nt9.96□□□□□ -0.81
CLF1Q12309 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt9.95□□□□□ -0.82
CLF1Q12309 AIM1YAL046C 357 nt9.95□□□□□ -0.82
CLF1Q12309 NIF3YGL221C 867 nt9.94□□□□□ -0.82
CLF1Q12309 YJR114WYJR114W 393 nt9.94□□□□□ -0.82
CLF1Q12309 CCT2YIL142W 1584 nt9.93□□□□□ -0.82
CLF1Q12309 ABZ2YMR289W 1125 nt9.93□□□□□ -0.82
CLF1Q12309 ENT4YLL038C 744 nt9.91□□□□□ -0.82
CLF1Q12309 ENO2YHR174W 1314 nt9.9□□□□□ -0.82
CLF1Q12309 TVP23YDR084C 600 nt9.9□□□□□ -0.82
CLF1Q12309 YOR325WYOR325W 474 nt9.9□□□□□ -0.82
CLF1Q12309 TIP1YBR067C 633 nt9.9□□□□□ -0.82
CLF1Q12309 IGD1YFR017C 588 nt9.89□□□□□ -0.83
CLF1Q12309 TIM44YIL022W 1296 nt9.89□□□□□ -0.83
CLF1Q12309 OPI10YOL032W 741 nt9.89□□□□□ -0.83
CLF1Q12309 ILV3YJR016C 1758 nt9.88□□□□□ -0.83
CLF1Q12309 SLG1YOR008C 1137 nt9.87□□□□□ -0.83
CLF1Q12309 RIM8YGL045W 1629 nt9.86□□□□□ -0.83
CLF1Q12309 MUP1YGR055W 1725 nt9.86□□□□□ -0.83
CLF1Q12309 YLR046CYLR046C 813 nt9.86□□□□□ -0.83
CLF1Q12309 SPE2YOL052C 1191 nt9.85□□□□□ -0.83
CLF1Q12309 BET2YPR176C 978 nt9.85□□□□□ -0.83
CLF1Q12309 DIG1YPL049C 1359 nt9.85□□□□□ -0.83
CLF1Q12309 OPI3YJR073C 621 nt9.83□□□□□ -0.84
CLF1Q12309 MAE1YKL029C 2010 nt9.83□□□□□ -0.84
CLF1Q12309 YCR025CYCR025C 411 nt9.81□□□□□ -0.84
CLF1Q12309 ACO2YJL200C 2370 nt9.8□□□□□ -0.84
CLF1Q12309 QDR2YIL121W 1629 nt9.8□□□□□ -0.84
CLF1Q12309 HOL1YNR055C 1761 nt9.79□□□□□ -0.84
CLF1Q12309 AMF1YOR378W 1548 nt9.79□□□□□ -0.84
CLF1Q12309 YNR064CYNR064C 873 nt9.79□□□□□ -0.84
CLF1Q12309 RSC4YKR008W 1878 nt9.79□□□□□ -0.84
CLF1Q12309 TPC1YGR096W 945 nt9.78□□□□□ -0.84
CLF1Q12309 IPL1YPL209C 1104 nt9.78□□□□□ -0.84
CLF1Q12309 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt9.77□□□□□ -0.85
CLF1Q12309 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt9.77□□□□□ -0.85
CLF1Q12309 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt9.77□□□□□ -0.85
CLF1Q12309 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt9.77□□□□□ -0.85
CLF1Q12309 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt9.77□□□□□ -0.85
CLF1Q12309 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt9.77□□□□□ -0.85
CLF1Q12309 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt9.77□□□□□ -0.85
CLF1Q12309 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt9.77□□□□□ -0.85
CLF1Q12309 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt9.77□□□□□ -0.85
CLF1Q12309 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt9.77□□□□□ -0.85
CLF1Q12309 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt9.77□□□□□ -0.85
CLF1Q12309 NME1NME1 340 nt9.77□□□□□ -0.85
CLF1Q12309 THP3YPR045C 1413 nt9.76□□□□□ -0.85
CLF1Q12309 SAC7YDR389W 1965 nt9.76□□□□□ -0.85
CLF1Q12309 YGL114WYGL114W 2178 nt9.76□□□□□ -0.85
CLF1Q12309 NAS2YIL007C 663 nt9.76□□□□□ -0.85
CLF1Q12309 MCM5YLR274W 2328 nt9.76□□□□□ -0.85
CLF1Q12309 PCP1YGR101W 1041 nt9.74□□□□□ -0.85
CLF1Q12309 FSH2YMR222C 672 nt9.73□□□□□ -0.85
CLF1Q12309 LEU2YCL018W 1095 nt9.73□□□□□ -0.85
CLF1Q12309 LSB6YJL100W 1824 nt9.72□□□□□ -0.85
CLF1Q12309 ELO1YJL196C 933 nt9.72□□□□□ -0.85
CLF1Q12309 YCP4YCR004C 744 nt9.71□□□□□ -0.86
CLF1Q12309 MOB1YIL106W 945 nt9.71□□□□□ -0.86
CLF1Q12309 KEL3YPL263C 1956 nt9.7□□□□□ -0.86
CLF1Q12309 FRA1YLL029W 2250 nt9.7□□□□□ -0.86
CLF1Q12309 ARO8YGL202W 1503 nt9.7□□□□□ -0.86
CLF1Q12309 FLX1YIL134W 936 nt9.69□□□□□ -0.86
CLF1Q12309 YKR012CYKR012C 378 nt9.69□□□□□ -0.86
CLF1Q12309 ADH3YMR083W 1128 nt9.69□□□□□ -0.86
CLF1Q12309 SAM50YNL026W 1455 nt9.68□□□□□ -0.86
CLF1Q12309 RIB1YBL033C 1038 nt9.68□□□□□ -0.86
CLF1Q12309 KES1YPL145C 1305 nt9.67□□□□□ -0.86
CLF1Q12309 YIA6YIL006W 1122 nt9.67□□□□□ -0.86
CLF1Q12309 CDD1YLR245C 429 nt9.67□□□□□ -0.86
CLF1Q12309 SOD2YHR008C 702 nt9.66□□□□□ -0.86
CLF1Q12309 CYC3YAL039C 810 nt9.65□□□□□ -0.86
CLF1Q12309 snR31snR31 225 nt9.65□□□□□ -0.86
CLF1Q12309 NAM8YHR086W 1572 nt9.65□□□□□ -0.86
CLF1Q12309 COQ8YGL119W 1506 nt9.65□□□□□ -0.86
CLF1Q12309 ITR2YOL103W 1830 nt9.65□□□□□ -0.86
CLF1Q12309 DLD3YEL071W 1491 nt9.65□□□□□ -0.87
CLF1Q12309 GID8YMR135C 1368 nt9.64□□□□□ -0.87
CLF1Q12309 PHB2YGR231C 933 nt9.64□□□□□ -0.87
CLF1Q12309 RPN14YGL004C 1254 nt9.62□□□□□ -0.87
CLF1Q12309 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.61□□□□□ -0.87
CLF1Q12309 VMA11YPL234C 495 nt9.61□□□□□ -0.87
CLF1Q12309 LYS20YDL182W 1287 nt9.6□□□□□ -0.87
CLF1Q12309 SWT21YNL187W 1074 nt9.6□□□□□ -0.87
CLF1Q12309 HAP5YOR358W 729 nt9.6□□□□□ -0.87
CLF1Q12309 ENO1YGR254W 1314 nt9.59□□□□□ -0.87
CLF1Q12309 YKL133CYKL133C 1392 nt9.59□□□□□ -0.87
CLF1Q12309 YMR265CYMR265C 1386 nt9.59□□□□□ -0.87
CLF1Q12309 ERG6YML008C 1152 nt9.58□□□□□ -0.88
CLF1Q12309 SER2YGR208W 930 nt9.57□□□□□ -0.88
CLF1Q12309 LSR1LSR1 1175 nt9.57□□□□□ -0.88
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