Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 HAT2YEL056W 1206 nt8.73□□□□□ -1.01
TY1A-BLQ12266 ATG15YCR068W 1563 nt8.73□□□□□ -1.01
TY1A-BLQ12266 XYL2YLR070C 1071 nt8.72□□□□□ -1.01
TY1A-BLQ12266 YML089CYML089C 369 nt8.72□□□□□ -1.01
TY1A-BLQ12266 HAT1YPL001W 1125 nt8.72□□□□□ -1.01
TY1A-BLQ12266 YGL034CYGL034C 366 nt8.71□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 RAD17YOR368W 1206 nt8.71□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 YBR292CYBR292C 372 nt8.7□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 PEX2YJL210W 816 nt8.69□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 YIF1YNL263C 945 nt8.69□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.69□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.69□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 HMRA1YCR097W 381 nt8.68□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 SAM35YHR083W 990 nt8.68□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 MIX17YMR002W 471 nt8.68□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 ARC35YNR035C 1029 nt8.68□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 YPR150WYPR150W 522 nt8.68□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 EEB1YPL095C 1371 nt8.68□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 ZRT3YKL175W 1512 nt8.68□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 DAL2YIR029W 1032 nt8.67□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 KDX1YKL161C 1302 nt8.67□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 RRS1YOR294W 612 nt8.67□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 TGS1YPL157W 948 nt8.67□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 TIF6YPR016C 738 nt8.67□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 HIP1YGR191W 1812 nt8.66□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 KRE28YDR532C 1158 nt8.66□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 CTK2YJL006C 972 nt8.66□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 NMD4YLR363C 657 nt8.66□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 DIF1YLR437C 402 nt8.66□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 RCE1YMR274C 948 nt8.66□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 YCR087WYCR087W 516 nt8.65□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 MRP20YDR405W 792 nt8.65□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 RAI1YGL246C 1164 nt8.65□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 PEX22YAL055W 543 nt8.65□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 OCA1YNL099C 717 nt8.65□□□□□ -1.02
TY1A-BLQ12266 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt8.64□□□□□ -1.03
TY1A-BLQ12266 RSF1YMR030W 1131 nt8.64□□□□□ -1.03
TY1A-BLQ12266 YNL165WYNL165W 1221 nt8.64□□□□□ -1.03
TY1A-BLQ12266 YJL211CYJL211C 444 nt8.63□□□□□ -1.03
TY1A-BLQ12266 VAM3YOR106W 852 nt8.63□□□□□ -1.03
TY1A-BLQ12266 DSE3YOR264W 1293 nt8.63□□□□□ -1.03
TY1A-BLQ12266 AIM45YPR004C 1035 nt8.63□□□□□ -1.03
TY1A-BLQ12266 YKR104WYKR104W 921 nt8.62□□□□□ -1.03
TY1A-BLQ12266 VPS20YMR077C 666 nt8.62□□□□□ -1.03
TY1A-BLQ12266 RTG3YBL103C 1461 nt8.62□□□□□ -1.03
TY1A-BLQ12266 YHR022CYHR022C 771 nt8.61□□□□□ -1.03
TY1A-BLQ12266 CBS1YDL069C 690 nt8.6□□□□□ -1.03
TY1A-BLQ12266 MER1YNL210W 813 nt8.6□□□□□ -1.03
TY1A-BLQ12266 CWC25YNL245C 540 nt8.6□□□□□ -1.03
TY1A-BLQ12266 YJL067WYJL067W 351 nt8.59□□□□□ -1.03
TY1A-BLQ12266 YLR198CYLR198C 360 nt8.59□□□□□ -1.03
TY1A-BLQ12266 TFB4YPR056W 1017 nt8.59□□□□□ -1.03
TY1A-BLQ12266 SVF1YDR346C 1446 nt8.59□□□□□ -1.03
TY1A-BLQ12266 RBG1YAL036C 1110 nt8.58□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 YAP7YOL028C 738 nt8.58□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 RRP15YPR143W 753 nt8.58□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 RPL4BYDR012W 1089 nt8.57□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 MET28YIR017C 564 nt8.57□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 DSC2YOL073C 969 nt8.57□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 RPL4AYBR031W 1089 nt8.57□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 HEL2YDR266C 1920 nt8.56□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 RIM8YGL045W 1629 nt8.56□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 FSH1YHR049W 732 nt8.56□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 RPS14BYJL191W 417 nt8.56□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 MHO1YJR008W 1017 nt8.56□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 JJJ3YJR097W 519 nt8.56□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 RPF2YKR081C 1035 nt8.56□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 ISA2YPR067W 558 nt8.56□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 MUP1YGR055W 1725 nt8.56□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 NRT1YOR071C 1797 nt8.56□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 DBP1YPL119C 1854 nt8.55□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 OCA4YCR095C 1089 nt8.55□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 YEA4YEL004W 1029 nt8.55□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt8.55□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 UTH1YKR042W 1098 nt8.55□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 PRE2YPR103W 864 nt8.55□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 ALG7YBR243C 1347 nt8.54□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 HXT1YHR094C 1713 nt8.54□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 HOL1YNR055C 1761 nt8.53□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 CHA1YCL064C 1083 nt8.53□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 YAR028WYAR028W 705 nt8.53□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 YLR460CYLR460C 1131 nt8.53□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 YKR015CYKR015C 1707 nt8.53□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 MTG2YHR168W 1557 nt8.52□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 YGL114WYGL114W 2178 nt8.52□□□□□ -1.04
TY1A-BLQ12266 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.52□□□□□ -1.05
TY1A-BLQ12266 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.52□□□□□ -1.05
TY1A-BLQ12266 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.52□□□□□ -1.05
TY1A-BLQ12266 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.52□□□□□ -1.05
TY1A-BLQ12266 IZH4YOL101C 939 nt8.52□□□□□ -1.05
TY1A-BLQ12266 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.52□□□□□ -1.05
TY1A-BLQ12266 MGR3YMR115W 1506 nt8.52□□□□□ -1.05
TY1A-BLQ12266 SSN3YPL042C 1668 nt8.51□□□□□ -1.05
TY1A-BLQ12266 PTC7YHR076W 1032 nt8.51□□□□□ -1.05
TY1A-BLQ12266 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt8.51□□□□□ -1.05
TY1A-BLQ12266 RRP17YDR412W 708 nt8.5□□□□□ -1.05
TY1A-BLQ12266 REX3YLR107W 1215 nt8.5□□□□□ -1.05
TY1A-BLQ12266 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt8.5□□□□□ -1.05
TY1A-BLQ12266 LIP1YMR298W 453 nt8.5□□□□□ -1.05
TY1A-BLQ12266 YIL092WYIL092W 1902 nt8.49□□□□□ -1.05
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