Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 YSR3YKR053C 1215 nt8.36□□□□□ -1.07
MSH5Q12175 FIT3YOR383C 615 nt8.36□□□□□ -1.07
MSH5Q12175 TOM71YHR117W 1920 nt8.35□□□□□ -1.07
MSH5Q12175 HXT12YIL170W 1374 nt8.35□□□□□ -1.07
MSH5Q12175 BNI5YNL166C 1347 nt8.34□□□□□ -1.07
MSH5Q12175 CLB6YGR109C 1143 nt8.34□□□□□ -1.07
MSH5Q12175 HXT11YOL156W 1704 nt8.34□□□□□ -1.07
MSH5Q12175 RSC4YKR008W 1878 nt8.34□□□□□ -1.07
MSH5Q12175 ALR1YOL130W 2580 nt8.33□□□□□ -1.08
MSH5Q12175 YDR467CYDR467C 327 nt8.33□□□□□ -1.08
MSH5Q12175 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.33□□□□□ -1.08
MSH5Q12175 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.33□□□□□ -1.08
MSH5Q12175 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.33□□□□□ -1.08
MSH5Q12175 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.33□□□□□ -1.08
MSH5Q12175 THI6YPL214C 1623 nt8.32□□□□□ -1.08
MSH5Q12175 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.32□□□□□ -1.08
MSH5Q12175 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.32□□□□□ -1.08
MSH5Q12175 YNL190WYNL190W 615 nt8.32□□□□□ -1.08
MSH5Q12175 FRA1YLL029W 2250 nt8.31□□□□□ -1.08
MSH5Q12175 MSC1YML128C 1542 nt8.31□□□□□ -1.08
MSH5Q12175 YCR087WYCR087W 516 nt8.31□□□□□ -1.08
MSH5Q12175 RPL4BYDR012W 1089 nt8.31□□□□□ -1.08
MSH5Q12175 RPL4AYBR031W 1089 nt8.31□□□□□ -1.08
MSH5Q12175 PFS2YNL317W 1398 nt8.3□□□□□ -1.08
MSH5Q12175 SOL2YCR073W-A 948 nt8.29□□□□□ -1.08
MSH5Q12175 GPN2YOR262W 1044 nt8.29□□□□□ -1.08
MSH5Q12175 EMC3YKL207W 762 nt8.28□□□□□ -1.08
MSH5Q12175 SRM1YGL097W 1449 nt8.28□□□□□ -1.08
MSH5Q12175 RRT5YFR032C 870 nt8.27□□□□□ -1.09
MSH5Q12175 THI74YDR438W 1113 nt8.26□□□□□ -1.09
MSH5Q12175 XYL2YLR070C 1071 nt8.26□□□□□ -1.09
MSH5Q12175 HSV2YGR223C 1347 nt8.26□□□□□ -1.09
MSH5Q12175 RPS14BYJL191W 417 nt8.25□□□□□ -1.09
MSH5Q12175 LAS17YOR181W 1902 nt8.24□□□□□ -1.09
MSH5Q12175 FTH1YBR207W 1398 nt8.23□□□□□ -1.09
MSH5Q12175 GND1YHR183W 1470 nt8.23□□□□□ -1.09
MSH5Q12175 SFL1YOR140W 2301 nt8.22□□□□□ -1.09
MSH5Q12175 RAS2YNL098C 969 nt8.22□□□□□ -1.09
MSH5Q12175 YDR455CYDR455C 309 nt8.21□□□□□ -1.1
MSH5Q12175 YRF1-1YDR545W 5391 nt8.2□□□□□ -1.1
MSH5Q12175 YRF1-5YLR467W 5391 nt8.2□□□□□ -1.1
MSH5Q12175 YRF1-8YOR396W 5391 nt8.2□□□□□ -1.1
MSH5Q12175 AIM45YPR004C 1035 nt8.2□□□□□ -1.1
MSH5Q12175 DIA4YHR011W 1341 nt8.2□□□□□ -1.1
MSH5Q12175 AAT1YKL106W 1356 nt8.2□□□□□ -1.1
MSH5Q12175 AIM34YMR003W 597 nt8.19□□□□□ -1.1
MSH5Q12175 YBL095WYBL095W 813 nt8.19□□□□□ -1.1
MSH5Q12175 MDH2YOL126C 1134 nt8.19□□□□□ -1.1
MSH5Q12175 SLM3YDL033C 1254 nt8.18□□□□□ -1.1
MSH5Q12175 YMR210WYMR210W 1350 nt8.18□□□□□ -1.1
MSH5Q12175 YMR265CYMR265C 1386 nt8.16□□□□□ -1.1
MSH5Q12175 MCM5YLR274W 2328 nt8.15□□□□□ -1.1
MSH5Q12175 YGL034CYGL034C 366 nt8.15□□□□□ -1.1
MSH5Q12175 SAC7YDR389W 1965 nt8.15□□□□□ -1.11
MSH5Q12175 ERG13YML126C 1476 nt8.14□□□□□ -1.11
MSH5Q12175 NUC1YJL208C 990 nt8.14□□□□□ -1.11
MSH5Q12175 GPM1YKL152C 744 nt8.14□□□□□ -1.11
MSH5Q12175 LOT5YKL183W 921 nt8.14□□□□□ -1.11
MSH5Q12175 NAT4YMR069W 858 nt8.13□□□□□ -1.11
MSH5Q12175 YMC2YBR104W 990 nt8.13□□□□□ -1.11
MSH5Q12175 CHA1YCL064C 1083 nt8.12□□□□□ -1.11
MSH5Q12175 APT2YDR441C 546 nt8.12□□□□□ -1.11
MSH5Q12175 RPN14YGL004C 1254 nt8.12□□□□□ -1.11
MSH5Q12175 YLR279WYLR279W 390 nt8.12□□□□□ -1.11
MSH5Q12175 TSC10YBR265W 963 nt8.12□□□□□ -1.11
MSH5Q12175 ITR1YDR497C 1755 nt8.12□□□□□ -1.11
MSH5Q12175 ELO1YJL196C 933 nt8.11□□□□□ -1.11
MSH5Q12175 PAU16YKL224C 372 nt8.11□□□□□ -1.11
MSH5Q12175 HAP5YOR358W 729 nt8.11□□□□□ -1.11
MSH5Q12175 NSG2YNL156C 900 nt8.1□□□□□ -1.11
MSH5Q12175 YLR072WYLR072W 2082 nt8.09□□□□□ -1.11
MSH5Q12175 FRT1YOR324C 1809 nt8.09□□□□□ -1.11
MSH5Q12175 PRC1YMR297W 1599 nt8.09□□□□□ -1.11
MSH5Q12175 MSB4YOL112W 1479 nt8.08□□□□□ -1.12
MSH5Q12175 CSM1YCR086W 573 nt8.08□□□□□ -1.12
MSH5Q12175 EAF3YPR023C 1206 nt8.08□□□□□ -1.12
MSH5Q12175 YDR094WYDR094W 336 nt8.07□□□□□ -1.12
MSH5Q12175 ATP10YLR393W 840 nt8.07□□□□□ -1.12
MSH5Q12175 PMT7YDR307W 1989 nt8.07□□□□□ -1.12
MSH5Q12175 TOP3YLR234W 1971 nt8.07□□□□□ -1.12
MSH5Q12175 SUV3YPL029W 2214 nt8.07□□□□□ -1.12
MSH5Q12175 FCY21YER060W 1587 nt8.06□□□□□ -1.12
MSH5Q12175 GGC1YDL198C 903 nt8.06□□□□□ -1.12
MSH5Q12175 LEA1YPL213W 717 nt8.06□□□□□ -1.12
MSH5Q12175 YLR173WYLR173W 1827 nt8.05□□□□□ -1.12
MSH5Q12175 OYE2YHR179W 1203 nt8.04□□□□□ -1.12
MSH5Q12175 SPE4YLR146C 903 nt8.04□□□□□ -1.12
MSH5Q12175 YPL264CYPL264C 1062 nt8.04□□□□□ -1.12
MSH5Q12175 YGR012WYGR012W 1182 nt8.03□□□□□ -1.12
MSH5Q12175 ERG6YML008C 1152 nt8.03□□□□□ -1.12
MSH5Q12175 YIL177CYIL177C 5277 nt8.03□□□□□ -1.12
MSH5Q12175 PMA2YPL036W 2844 nt8.03□□□□□ -1.12
MSH5Q12175 YNR064CYNR064C 873 nt8.02□□□□□ -1.13
MSH5Q12175 SDH5YOL071W 489 nt8.02□□□□□ -1.13
MSH5Q12175 BEM1YBR200W 1656 nt8.02□□□□□ -1.13
MSH5Q12175 CTF3YLR381W 2202 nt8.01□□□□□ -1.13
MSH5Q12175 KEL3YPL263C 1956 nt8.01□□□□□ -1.13
MSH5Q12175 DDI1YER143W 1287 nt8□□□□□ -1.13
MSH5Q12175 PRY1YJL079C 900 nt8□□□□□ -1.13
MSH5Q12175 SAM3YPL274W 1764 nt7.99□□□□□ -1.13
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