Protein–RNA interactions for Protein: Q06485

ATG33, Autophagy-related protein 33, yeastyeast

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG33Q06485 YER039C-AYER039C-A 219 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 SPT4YGR063C 309 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 MSL1YIR009W 336 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 TCP1YDR212W 1680 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 PUF6YDR496C 1971 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 KSP1YHR082C 3090 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 CDC24YAL041W 2565 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 YDL071CYDL071C 375 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 YDR193WYDR193W 399 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 YHL037CYHL037C 402 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 ANB1YJR047C 474 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 YAF9YNL107W 681 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 ROX1YPR065W 1107 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 YPR089WYPR089W 2667 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 MET6YER091C 2304 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 GIS4YML006C 2325 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 ECM21YBL101C 3354 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 YDL152WYDL152W 366 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 UTP30YKR060W 825 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 FPR1YNL135C 345 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 RRM3YHR031C 2172 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 NAN1YPL126W 2691 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 PDR12YPL058C 4536 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 BMS1YPL217C 3552 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 FCF2YLR051C 654 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 FIR1YER032W 2631 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 VPS41YDR080W 2979 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG33Q06485 YER121WYER121W 345 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 GIN4YDR507C 3429 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 RRP5YMR229C 5190 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 TCB3YML072C 4638 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 VPS64YDR200C 1815 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 YDR008CYDR008C 351 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 YDR413CYDR413C 576 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 YFL065CYFL065C 309 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 YFR056CYFR056C 369 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 SPA2YLL021W 4401 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 YMR324CYMR324C 243 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 CRS5YOR031W 210 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 YPL182CYPL182C 384 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 YPR146CYPR146C 330 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 PRP6YBR055C 2700 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 PCF11YDR228C 1881 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 PTC5YOR090C 1719 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 SSN2YDR443C 4263 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 YDL011CYDL011C 324 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 NHP2YDL208W 471 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 GLC3YEL011W 2115 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 HMF1YER057C 390 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 KIN2YLR096W 3444 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 NCL1YBL024W 2055 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 REV1YOR346W 2958 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 SAK1YER129W 3429 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 LSO2YGR169C-A 279 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 YJL202CYJL202C 348 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 IRC23YOR044W 474 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 TIM18YOR297C 579 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 FMP23YBR047W 528 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 UBP11YKR098C 2154 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 IPT1YDR072C 1584 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 SWT1YOR166C 1377 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 SLA1YBL007C 3735 nt2.86□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 YDR102CYDR102C 333 nt2.86□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 SHH3YMR118C 591 nt2.86□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 PGA1YNL158W 597 nt2.86□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 FLO1YAR050W 4614 nt2.86□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 FRT2YAL028W 1587 nt2.86□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 KAR3YPR141C 2190 nt2.85□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 MPH1YIR002C 2982 nt2.85□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 SDC25YLL016W 3147 nt2.85□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 TAF1YGR274C 3201 nt2.85□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 RLI1YDR091C 1827 nt2.85□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 YER097WYER097W 330 nt2.85□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 LSM7YNL147W 348 nt2.85□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 YBL073WYBL073W 312 nt2.85□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 RDS1YCR106W 2499 nt2.85□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 SIN3YOL004W 4611 nt2.85□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 ISF1YMR081C 1017 nt2.84□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 RPL36AYMR194W 303 nt2.84□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 RPS8AYBL072C 603 nt2.84□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt2.84□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 ROM1YGR070W 3468 nt2.84□□□□□ -1.95
ATG33Q06485 CDC20YGL116W 1833 nt2.84□□□□□ -1.96
ATG33Q06485 YJL070CYJL070C 2667 nt2.83□□□□□ -1.96
ATG33Q06485 BMH2YDR099W 822 nt2.83□□□□□ -1.96
ATG33Q06485 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt2.83□□□□□ -1.96
ATG33Q06485 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.83□□□□□ -1.96
ATG33Q06485 RPL26AYLR344W 384 nt2.83□□□□□ -1.96
ATG33Q06485 GRX8YLR364W 330 nt2.83□□□□□ -1.96
ATG33Q06485 YOR050CYOR050C 348 nt2.83□□□□□ -1.96
ATG33Q06485 SNT1YCR033W 3681 nt2.82□□□□□ -1.96
ATG33Q06485 SNU114YKL173W 3027 nt2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.1 ms