Protein–RNA interactions for Protein: Q05580

HEL2, E3 ubiquitin-protein ligase HEL2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEL2Q05580 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt2.59□□□□□ -1.99
HEL2Q05580 VID24YBR105C 1089 nt2.59□□□□□ -1.99
HEL2Q05580 MRD1YPR112C 2664 nt2.59□□□□□ -2
HEL2Q05580 YRR1YOR162C 2433 nt2.59□□□□□ -2
HEL2Q05580 PUF4YGL014W 2667 nt2.58□□□□□ -2
HEL2Q05580 YAP6YDR259C 1152 nt2.58□□□□□ -2
HEL2Q05580 BNA7YDR428C 786 nt2.58□□□□□ -2
HEL2Q05580 TIM9YEL020W-A 264 nt2.58□□□□□ -2
HEL2Q05580 CHZ1YER030W 462 nt2.58□□□□□ -2
HEL2Q05580 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.58□□□□□ -2
HEL2Q05580 YER079WYER079W 633 nt2.58□□□□□ -2
HEL2Q05580 AGA2YGL032C 264 nt2.58□□□□□ -2
HEL2Q05580 UTP30YKR060W 825 nt2.58□□□□□ -2
HEL2Q05580 YLR171WYLR171W 390 nt2.58□□□□□ -2
HEL2Q05580 PBI2YNL015W 228 nt2.58□□□□□ -2
HEL2Q05580 ESF2YNR054C 951 nt2.58□□□□□ -2
HEL2Q05580 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.58□□□□□ -2
HEL2Q05580 SMC6YLR383W 3345 nt2.58□□□□□ -2
HEL2Q05580 NPR1YNL183C 2373 nt2.57□□□□□ -2
HEL2Q05580 ADK1YDR226W 669 nt2.57□□□□□ -2
HEL2Q05580 GLC7YER133W 939 nt2.57□□□□□ -2
HEL2Q05580 YGR050CYGR050C 357 nt2.57□□□□□ -2
HEL2Q05580 NFU1YKL040C 771 nt2.57□□□□□ -2
HEL2Q05580 TIF11YMR260C 462 nt2.57□□□□□ -2
HEL2Q05580 VPS13YLL040C 9435 nt2.57□□□□□ -2
HEL2Q05580 KSP1YHR082C 3090 nt2.56□□□□□ -2
HEL2Q05580 FKS3YMR306W 5358 nt2.56□□□□□ -2
HEL2Q05580 YAP3YHL009C 993 nt2.56□□□□□ -2
HEL2Q05580 RGA1YOR127W 3024 nt2.56□□□□□ -2
HEL2Q05580 YKR078WYKR078W 1758 nt2.56□□□□□ -2
HEL2Q05580 AFI1YOR129C 2682 nt2.55□□□□□ -2
HEL2Q05580 YGL042CYGL042C 306 nt2.55□□□□□ -2
HEL2Q05580 CRG1YHR209W 876 nt2.55□□□□□ -2
HEL2Q05580 TPM2YIL138C 486 nt2.55□□□□□ -2
HEL2Q05580 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.55□□□□□ -2
HEL2Q05580 EMC6YLL014W 327 nt2.55□□□□□ -2
HEL2Q05580 CTK3YML112W 891 nt2.55□□□□□ -2
HEL2Q05580 CMC2YBL059C-A 330 nt2.55□□□□□ -2
HEL2Q05580 FYV12YOR183W 390 nt2.55□□□□□ -2
HEL2Q05580 SVS1YPL163C 783 nt2.55□□□□□ -2
HEL2Q05580 TPS2YDR074W 2691 nt2.55□□□□□ -2
HEL2Q05580 HAA1YPR008W 2085 nt2.54□□□□□ -2
HEL2Q05580 YIL080WYIL080W 4722 nt2.54□□□□□ -2
HEL2Q05580 YDR269CYDR269C 324 nt2.54□□□□□ -2
HEL2Q05580 YER087C-AYER087C-A 552 nt2.54□□□□□ -2
HEL2Q05580 YGR242WYGR242W 309 nt2.54□□□□□ -2
HEL2Q05580 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt2.54□□□□□ -2
HEL2Q05580 RGM1YMR182C 636 nt2.54□□□□□ -2
HEL2Q05580 PEP12YOR036W 867 nt2.54□□□□□ -2
HEL2Q05580 IRC16YPR038W 360 nt2.54□□□□□ -2
HEL2Q05580 BAS1YKR099W 2436 nt2.54□□□□□ -2
HEL2Q05580 PES4YFR023W 1836 nt2.54□□□□□ -2
HEL2Q05580 KEL2YGR238C 2649 nt2.54□□□□□ -2
HEL2Q05580 YIL166CYIL166C 1629 nt2.53□□□□□ -2
HEL2Q05580 RRI2YOL117W 1938 nt2.53□□□□□ -2
HEL2Q05580 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.53□□□□□ -2
HEL2Q05580 RTS3YGR161C 792 nt2.53□□□□□ -2
HEL2Q05580 RNP1YLL046C 750 nt2.53□□□□□ -2
HEL2Q05580 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.53□□□□□ -2
HEL2Q05580 KTI11YBL071W-A 249 nt2.53□□□□□ -2
HEL2Q05580 VTC3YPL019C 2508 nt2.53□□□□□ -2
HEL2Q05580 HOS4YIL112W 3252 nt2.53□□□□□ -2
HEL2Q05580 TUS1YLR425W 3924 nt2.52□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 STE11YLR362W 2154 nt2.52□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 RGA2YDR379W 3030 nt2.52□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 ATG31YDR022C 591 nt2.52□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 RPS17BYDR447C 411 nt2.52□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.52□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 HRI1YLR301W 735 nt2.52□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 RIO2YNL207W 1278 nt2.52□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 ALG14YBR070C 714 nt2.52□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 SPE1YKL184W 1401 nt2.51□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 ARP8YOR141C 2646 nt2.51□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 GPI17YDR434W 1605 nt2.51□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 YDL009CYDL009C 324 nt2.51□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 FYV4YHR059W 393 nt2.51□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 YHR130CYHR130C 336 nt2.51□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 YHR138CYHR138C 345 nt2.51□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 PAU14YIL176C 363 nt2.51□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.51□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 YJL202CYJL202C 348 nt2.51□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 PAU1YJL223C 363 nt2.51□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt2.51□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 PSY1YKL076C 384 nt2.51□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 AFB1YLR040C 675 nt2.51□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 TOF1YNL273W 3717 nt2.51□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 PSK2YOL045W 3306 nt2.51□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.5□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt2.5□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 PEX17YNL214W 600 nt2.5□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 CDC33YOL139C 642 nt2.5□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 RUD3YOR216C 1455 nt2.5□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 TOR1YJR066W 7413 nt2.5□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 YER138CYER138C 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 YER160CYER160C 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
HEL2Q05580 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 50.6 ms