Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms