Protein–RNA interactions for Protein: P25044

PTP1, Tyrosine-protein phosphatase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTP1P25044 YDR338CYDR338C 2088 nt2.9□□□□□ -1.95
PTP1P25044 RRT13YER066W 558 nt2.9□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.9□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YIL012WYIL012W 342 nt2.9□□□□□ -1.95
PTP1P25044 GPI14YJR013W 1212 nt2.9□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YAR068WYAR068W 486 nt2.9□□□□□ -1.95
PTP1P25044 JIP3YLR331C 378 nt2.9□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YPR053CYPR053C 456 nt2.9□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YLR278CYLR278C 4026 nt2.9□□□□□ -1.95
PTP1P25044 MET5YJR137C 4329 nt2.9□□□□□ -1.95
PTP1P25044 DRS2YAL026C 4068 nt2.89□□□□□ -1.95
PTP1P25044 MSL1YIR009W 336 nt2.89□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt2.89□□□□□ -1.95
PTP1P25044 LSM2YBL026W 288 nt2.89□□□□□ -1.95
PTP1P25044 PGA1YNL158W 597 nt2.89□□□□□ -1.95
PTP1P25044 CAF120YNL278W 3183 nt2.89□□□□□ -1.95
PTP1P25044 LYS9YNR050C 1341 nt2.89□□□□□ -1.95
PTP1P25044 SRP68YPL243W 1800 nt2.89□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YBP1YBR216C 2025 nt2.88□□□□□ -1.95
PTP1P25044 BUD4YJR092W 4344 nt2.88□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YEL075CYEL075C 369 nt2.88□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.88□□□□□ -1.95
PTP1P25044 AST2YER101C 1293 nt2.88□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YFR056CYFR056C 369 nt2.88□□□□□ -1.95
PTP1P25044 HCH1YNL281W 462 nt2.88□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YOL160WYOL160W 342 nt2.88□□□□□ -1.95
PTP1P25044 PEX5YDR244W 1839 nt2.88□□□□□ -1.95
PTP1P25044 EPL1YFL024C 2499 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 FRE2YKL220C 2136 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YCK3YER123W 1575 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 DYN1YKR054C 12279 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 PHO81YGR233C 3537 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 snR70snR70 164 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 PRE8YML092C 753 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 NDD1YOR372C 1665 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YER138CYER138C 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YER160CYER160C 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YJR027WYJR027W 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YML039WYML039W 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YML045WYML045W 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YMR050CYMR050C 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 CIN1YOR349W 3045 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 BNA4YBL098W 1383 nt2.87□□□□□ -1.95
PTP1P25044 CEP3YMR168C 1827 nt2.86□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YME2YMR302C 2553 nt2.86□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YGR265WYGR265W 411 nt2.86□□□□□ -1.95
PTP1P25044 PAU23YLR037C 375 nt2.86□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt2.86□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YPR203WYPR203W 309 nt2.86□□□□□ -1.95
PTP1P25044 XRN1YGL173C 4587 nt2.86□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YLL032CYLL032C 2478 nt2.86□□□□□ -1.95
PTP1P25044 VTC4YJL012C 2166 nt2.85□□□□□ -1.95
PTP1P25044 TAF2YCR042C 4224 nt2.85□□□□□ -1.95
PTP1P25044 NOT5YPR072W 1683 nt2.85□□□□□ -1.95
PTP1P25044 FAA2YER015W 2235 nt2.85□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YAT2YER024W 2772 nt2.85□□□□□ -1.95
PTP1P25044 CHS3YBR023C 3498 nt2.85□□□□□ -1.95
PTP1P25044 ARF1YDL192W 546 nt2.85□□□□□ -1.95
PTP1P25044 ATP17YDR377W 306 nt2.85□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.85□□□□□ -1.95
PTP1P25044 PFD1YJL179W 330 nt2.85□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YKL222CYKL222C 2118 nt2.85□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YBL073WYBL073W 312 nt2.85□□□□□ -1.95
PTP1P25044 HSP10YOR020C 321 nt2.85□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YOR296WYOR296W 3870 nt2.85□□□□□ -1.95
PTP1P25044 DNA2YHR164C 4569 nt2.85□□□□□ -1.95
PTP1P25044 HFM1YGL251C 3564 nt2.84□□□□□ -1.95
PTP1P25044 CBP2YHL038C 1893 nt2.84□□□□□ -1.95
PTP1P25044 ATP8Q0080 147 nt2.84□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt2.84□□□□□ -1.95
PTP1P25044 HMF1YER057C 390 nt2.84□□□□□ -1.95
PTP1P25044 RPC10YHR143W-A 213 nt2.84□□□□□ -1.95
PTP1P25044 PAU14YIL176C 363 nt2.84□□□□□ -1.95
PTP1P25044 PAU1YJL223C 363 nt2.84□□□□□ -1.95
PTP1P25044 SMA2YML066C 1110 nt2.84□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YPL039WYPL039W 951 nt2.84□□□□□ -1.95
PTP1P25044 YPL142CYPL142C 318 nt2.84□□□□□ -1.95
PTP1P25044 ICR1ICR1 3199 nt2.84□□□□□ -1.95
PTP1P25044 SSP1YHR184W 1716 nt2.84□□□□□ -1.96
PTP1P25044 RSN1YMR266W 2862 nt2.84□□□□□ -1.96
PTP1P25044 ORC1YML065W 2745 nt2.84□□□□□ -1.96
PTP1P25044 PUF6YDR496C 1971 nt2.83□□□□□ -1.96
PTP1P25044 RED1YLR263W 2484 nt2.83□□□□□ -1.96
PTP1P25044 ROG1YGL144C 2058 nt2.83□□□□□ -1.96
PTP1P25044 YDR061WYDR061W 1620 nt2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 50.7 ms