Protein–RNA interactions for Protein: P0CX15

YRF1-7, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 7, yeastyeast

Predictions only

Length 1,859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-7P0CX15 IQG1YPL242C 4488 nt1.12□□□□□ -2.23
YRF1-7P0CX15 DIG2YDR480W 972 nt1.12□□□□□ -2.23
YRF1-7P0CX15 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt1.12□□□□□ -2.23
YRF1-7P0CX15 YMR181CYMR181C 465 nt1.12□□□□□ -2.23
YRF1-7P0CX15 PRM4YPL156C 855 nt1.12□□□□□ -2.23
YRF1-7P0CX15 YPL238CYPL238C 390 nt1.12□□□□□ -2.23
YRF1-7P0CX15 JJJ2YJL162C 1752 nt1.11□□□□□ -2.23
YRF1-7P0CX15 YDR341CYDR341C 1824 nt1.11□□□□□ -2.23
YRF1-7P0CX15 FIG1YBR040W 897 nt1.11□□□□□ -2.23
YRF1-7P0CX15 YJL169WYJL169W 369 nt1.1□□□□□ -2.23
YRF1-7P0CX15 ERP4YOR016C 624 nt1.1□□□□□ -2.23
YRF1-7P0CX15 BAG7YOR134W 1230 nt1.1□□□□□ -2.23
YRF1-7P0CX15 DSE1YER124C 1722 nt1.1□□□□□ -2.23
YRF1-7P0CX15 TRL1YJL087C 2484 nt1.1□□□□□ -2.23
YRF1-7P0CX15 ARK1YNL020C 1917 nt1.1□□□□□ -2.23
YRF1-7P0CX15 MLH3YPL164C 2148 nt1.1□□□□□ -2.23
YRF1-7P0CX15 YDR124WYDR124W 975 nt1.09□□□□□ -2.23
YRF1-7P0CX15 YLR140WYLR140W 327 nt1.09□□□□□ -2.23
YRF1-7P0CX15 MGE1YOR232W 687 nt1.09□□□□□ -2.23
YRF1-7P0CX15 TYE7YOR344C 876 nt1.09□□□□□ -2.23
YRF1-7P0CX15 ATG5YPL149W 885 nt1.09□□□□□ -2.23
YRF1-7P0CX15 FMP27YLR454W 7887 nt1.09□□□□□ -2.23
YRF1-7P0CX15 PBP4YDL053C 558 nt1.09□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 RPL31AYDL075W 342 nt1.09□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 CRD1YDL142C 852 nt1.09□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 YGL039WYGL039W 1047 nt1.09□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 DSE2YHR143W 978 nt1.09□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.09□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 NGL1YOL042W 1092 nt1.09□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 YPR146CYPR146C 330 nt1.09□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 MED8YBR193C 672 nt1.09□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 RAD9YDR217C 3930 nt1.09□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt1.08□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 DIA1YMR316W 1011 nt1.08□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 YOL159CYOL159C 516 nt1.08□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 RPL37BYDR500C 267 nt1.07□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 YGR283CYGR283C 1026 nt1.07□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 ATG10YLL042C 504 nt1.07□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 ARC18YLR370C 537 nt1.07□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 SYO1YDL063C 1863 nt1.07□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 RSM22YKL155C 1887 nt1.07□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 SHR3YDL212W 633 nt1.07□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 NYV1YLR093C 762 nt1.07□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 YLR311CYLR311C 348 nt1.07□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 TIM18YOR297C 579 nt1.07□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 YSY6YBR162W-A 198 nt1.07□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 UBC5YDR059C 447 nt1.06□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 YGL242CYGL242C 546 nt1.06□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 YGR219WYGR219W 342 nt1.06□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 MCM22YJR135C 720 nt1.06□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 TEX1YNL253W 1269 nt1.06□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 SPC29YPL124W 762 nt1.06□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 snR35snR35 204 nt1.06□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 RPL35BYDL136W 363 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 YER087C-AYER087C-A 552 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 YHL044WYHL044W 708 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 FUS1YCL027W 1539 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 YDR018CYDR018C 1191 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 RPL34BYIL052C 366 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 IAH1YOR126C 717 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt1.04□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 WIP1YDR374W-A 270 nt1.04□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 SLF1YDR515W 1344 nt1.04□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 VPS28YPL065W 729 nt1.04□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 ESC2YDR363W 1371 nt1.03□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 snR68snR68 136 nt1.03□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 YEA4YEL004W 1029 nt1.03□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 MTG1YMR097C 1104 nt1.03□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 YOL014WYOL014W 375 nt1.03□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 MUM2YBR057C 1101 nt1.03□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 SST2YLR452C 2097 nt1.03□□□□□ -2.24
YRF1-7P0CX15 CDC36YDL165W 576 nt1.03□□□□□ -2.25
YRF1-7P0CX15 BNA7YDR428C 786 nt1.03□□□□□ -2.25
YRF1-7P0CX15 UBC7YMR022W 498 nt1.03□□□□□ -2.25
YRF1-7P0CX15 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt1.03□□□□□ -2.25
YRF1-7P0CX15 MNE1YOR350C 1992 nt1.02□□□□□ -2.25
YRF1-7P0CX15 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt1.02□□□□□ -2.25
YRF1-7P0CX15 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt1.02□□□□□ -2.25
YRF1-7P0CX15 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt1.02□□□□□ -2.25
YRF1-7P0CX15 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt1.02□□□□□ -2.25
YRF1-7P0CX15 AI3Q0060 1248 nt1.02□□□□□ -2.25
YRF1-7P0CX15 FSH1YHR049W 732 nt1.02□□□□□ -2.25
YRF1-7P0CX15 RPL6BYLR448W 531 nt1.02□□□□□ -2.25
YRF1-7P0CX15 RAD10YML095C 633 nt1.02□□□□□ -2.25
YRF1-7P0CX15 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt1.02□□□□□ -2.25
YRF1-7P0CX15 PES4YFR023W 1836 nt1.02□□□□□ -2.25
YRF1-7P0CX15 UTP8YGR128C 2142 nt1.02□□□□□ -2.25
YRF1-7P0CX15 SRB4YER022W 2064 nt1.02□□□□□ -2.25
YRF1-7P0CX15 YDR521WYDR521W 336 nt1.01□□□□□ -2.25
YRF1-7P0CX15 YGL165CYGL165C 579 nt1.01□□□□□ -2.25
YRF1-7P0CX15 STE5YDR103W 2754 nt1.01□□□□□ -2.25
YRF1-7P0CX15 BST1YFL025C 3090 nt1.01□□□□□ -2.25
YRF1-7P0CX15 SNF12YNR023W 1701 nt1.01□□□□□ -2.25
YRF1-7P0CX15 YER189WYER189W 369 nt1.01□□□□□ -2.25
YRF1-7P0CX15 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt1.01□□□□□ -2.25
YRF1-7P0CX15 RRT15YLR162W-A 189 nt1.01□□□□□ -2.25
YRF1-7P0CX15 PEX27YOR193W 1131 nt1.01□□□□□ -2.25
YRF1-7P0CX15 YBR277CYBR277C 402 nt1.01□□□□□ -2.25
YRF1-7P0CX15 YFR054CYFR054C 579 nt1□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 52.1 ms