Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNIKQ9UKE5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms