Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms