Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms