Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GRIN2AQ12879 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
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