Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 CDC50YCR094W 1176 nt3.36□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 HMF1YER057C 390 nt3.36□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 RMP1YLR145W 606 nt3.36□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 YNL179CYNL179C 438 nt3.36□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt3.36□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 ARR2YPR200C 393 nt3.36□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 SWD3YBR175W 948 nt3.36□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 BFR1YOR198C 1413 nt3.36□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 PDC2YDR081C 2778 nt3.35□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 STN1YDR082W 1485 nt3.35□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 SMB1YER029C 591 nt3.35□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 YER038W-AYER038W-A 381 nt3.35□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 RPL23BYER117W 414 nt3.35□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 TWF1YGR080W 999 nt3.35□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 MRPL31YKL138C 396 nt3.35□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 YML009C-AYML009C-A 327 nt3.35□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 RPL6AYML073C 531 nt3.35□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 FUN30YAL019W 3396 nt3.35□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 RNH70YGR276C 1662 nt3.34□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 ORC1YML065W 2745 nt3.34□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 SDH7YDR511W 402 nt3.34□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt3.34□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 YLR230WYLR230W 306 nt3.34□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 SMA2YML066C 1110 nt3.34□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 YBR209WYBR209W 318 nt3.34□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt3.34□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt3.34□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt3.34□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt3.34□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt3.34□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 YCL019WYCL019W 5313 nt3.34□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 HEH2YDR458C 1992 nt3.34□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 PBS2YJL128C 2007 nt3.34□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 ROG1YGL144C 2058 nt3.34□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 MSB2YGR014W 3921 nt3.33□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 RIF1YBR275C 5751 nt3.33□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt3.33□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt3.33□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 NMD2YHR077C 3270 nt3.32□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 ITC1YGL133W 3795 nt3.32□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 YIL054WYIL054W 318 nt3.32□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 LSM2YBL026W 288 nt3.32□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 HHT2YNL031C 411 nt3.32□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 YAF9YNL107W 681 nt3.32□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 COQ10YOL008W 624 nt3.32□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 ZEO1YOL109W 342 nt3.32□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 MED1YPR070W 1701 nt3.32□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 SRC1YML034W 2505 nt3.32□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 MET5YJR137C 4329 nt3.32□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 JJJ2YJL162C 1752 nt3.31□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 YKL100CYKL100C 1764 nt3.31□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 RPS24BYIL069C 408 nt3.31□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 YNL043CYNL043C 321 nt3.31□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt3.31□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 ICR1ICR1 3199 nt3.31□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 YGL165CYGL165C 579 nt3.3□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.3□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 ABM1YJR108W 372 nt3.3□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 YKL136WYKL136W 399 nt3.3□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 PAU23YLR037C 375 nt3.3□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 ERP4YOR016C 624 nt3.3□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 YEL1YBL060W 2064 nt3.3□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 SSP1YHR184W 1716 nt3.3□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 UTP13YLR222C 2454 nt3.29□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt3.29□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 YDR366CYDR366C 399 nt3.29□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 SOK1YDR006C 2706 nt3.29□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 SRB4YER022W 2064 nt3.29□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 VHR2YER064C 1518 nt3.29□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 RSE1YML049C 4086 nt3.29□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 YGR035CYGR035C 351 nt3.28□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 URA10YMR271C 684 nt3.28□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 RPL23AYBL087C 414 nt3.28□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 YOR121CYOR121C 306 nt3.28□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 TSC3YBR058C-A 243 nt3.28□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 RAX2YLR084C 3663 nt3.28□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 SNQ2YDR011W 4506 nt3.28□□□□□ -1.88
CLF1Q12309 DNA2YHR164C 4569 nt3.27□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 ILS1YBL076C 3219 nt3.27□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 ARK1YNL020C 1917 nt3.27□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 FYV4YHR059W 393 nt3.27□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 PEX17YNL214W 600 nt3.27□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 OST2YOR103C 393 nt3.27□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 TFB1YDR311W 1929 nt3.27□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 BIT61YJL058C 1632 nt3.26□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 AI2Q0055 2565 nt3.26□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 DYN1YKR054C 12279 nt3.26□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt3.26□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt3.26□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 PEP12YOR036W 867 nt3.26□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 RPL20BYOR312C 519 nt3.26□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 RPL33AYPL143W 324 nt3.26□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 JSN1YJR091C 3276 nt3.26□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 YCR022CYCR022C 345 nt3.25□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 RPS26BYER131W 360 nt3.25□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 ERP6YGL002W 651 nt3.25□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 YGR025WYGR025W 303 nt3.25□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 YKL118WYKL118W 312 nt3.25□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 MRPL50YNR022C 420 nt3.25□□□□□ -1.89
CLF1Q12309 CEP3YMR168C 1827 nt3.25□□□□□ -1.89
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