Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 SVS1YPL163C 783 nt2.54□□□□□ -2
RRN11Q04712 YPR014CYPR014C 330 nt2.54□□□□□ -2
RRN11Q04712 YEF3YLR249W 3135 nt2.54□□□□□ -2
RRN11Q04712 GIN4YDR507C 3429 nt2.54□□□□□ -2
RRN11Q04712 SLN1YIL147C 3663 nt2.53□□□□□ -2
RRN11Q04712 ESL2YKR096W 3588 nt2.53□□□□□ -2
RRN11Q04712 BNR1YIL159W 4128 nt2.53□□□□□ -2
RRN11Q04712 YDL009CYDL009C 324 nt2.53□□□□□ -2
RRN11Q04712 MRP10YDL045W-A 288 nt2.53□□□□□ -2
RRN11Q04712 BNA7YDR428C 786 nt2.53□□□□□ -2
RRN11Q04712 BI2Q0110 1272 nt2.53□□□□□ -2
RRN11Q04712 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt2.53□□□□□ -2
RRN11Q04712 RPS22AYJL190C 393 nt2.53□□□□□ -2
RRN11Q04712 PAU23YLR037C 375 nt2.53□□□□□ -2
RRN11Q04712 YLR171WYLR171W 390 nt2.53□□□□□ -2
RRN11Q04712 RPL16BYNL069C 597 nt2.53□□□□□ -2
RRN11Q04712 RPL25YOL127W 429 nt2.53□□□□□ -2
RRN11Q04712 YAP3YHL009C 993 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 BET3YKR068C 582 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 CTK3YML112W 891 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 YNL324WYNL324W 396 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 YDR338CYDR338C 2088 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 YBT1YLL048C 4986 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 MUD2YKL074C 1584 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 TFB1YDR311W 1929 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 DFG10YIL049W 762 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 AIM29YKR074W 468 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 YNL179CYNL179C 438 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 YNR021WYNR021W 1215 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 YBL108WYBL108W 306 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 IRC16YPR038W 360 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 RTT10YPL183C 3042 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 NEW1YPL226W 3591 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 SSF1YHR066W 1362 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 YRR1YOR162C 2433 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 SRB4YER022W 2064 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 YGL015CYGL015C 393 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 GET1YGL020C 708 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 RPI1YIL119C 1224 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 SAS2YMR127C 1017 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 SWM2YNR004W 441 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 COQ10YOL008W 624 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 ALG14YBR070C 714 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 MSS18YPR134W 807 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 SSP1YHR184W 1716 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 SLP1YOR154W 1764 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 YDR114CYDR114C 303 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 YEL057CYEL057C 702 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 HUR1YGL168W 333 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 YIL012WYIL012W 342 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 VPH2YKL119C 648 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 YLR302CYLR302C 363 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 RPS1AYLR441C 768 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 IGO1YNL157W 507 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 SFM1YOR021C 642 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 LEE1YPL054W 906 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 RSA1YPL193W 1146 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 YPK1YKL126W 2043 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 HNT1YDL125C 477 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 AGA2YGL032C 264 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 RPL14BYHL001W 417 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 OTU2YHL013C 924 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 EMC6YLL014W 327 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 YLR334CYLR334C 381 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 AXL1YPR122W 3627 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 BI4Q0120 1917 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 YFH1YDL120W 525 nt2.47□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 YRB1YDR002W 606 nt2.47□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 GIM4YEL003W 336 nt2.47□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.47□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 NOP19YGR251W 591 nt2.47□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 YHR130CYHR130C 336 nt2.47□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.47□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 JIP3YLR331C 378 nt2.47□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt2.47□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 KTI11YBL071W-A 249 nt2.47□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 SPE1YKL184W 1401 nt2.47□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 GCV2YMR189W 3105 nt2.46□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 YEL1YBL060W 2064 nt2.46□□□□□ -2.01
RRN11Q04712 BIT61YJL058C 1632 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 SPO23YBR250W 1572 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 YDR157WYDR157W 402 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 YHC1YLR298C 696 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 LSM2YBL026W 288 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 TIF11YMR260C 462 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 CMC2YBL059C-A 330 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 HEM4YOR278W 828 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 YPL034WYPL034W 498 nt2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 100.9 ms