Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

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Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 YJR141WYJR141W 1044 nt2.37□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 AFB1YLR040C 675 nt2.37□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 RPS29AYLR388W 171 nt2.37□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 BER1YLR412W 825 nt2.37□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 YML037CYML037C 1023 nt2.37□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.37□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 YOR283WYOR283W 693 nt2.37□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 RPL33AYPL143W 324 nt2.37□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 LOA1YPR139C 903 nt2.37□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 YNL018CYNL018C 1839 nt2.37□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 SWA2YDR320C 2007 nt2.37□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 NDD1YOR372C 1665 nt2.37□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 SPO13YHR014W 876 nt2.36□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 GIC1YHR061C 945 nt2.36□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 YIL174WYIL174W 228 nt2.36□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.36□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 KSP1YHR082C 3090 nt2.36□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 HSC82YMR186W 2118 nt2.36□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 AXL1YPR122W 3627 nt2.35□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 CRD1YDL142C 852 nt2.35□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 HYR1YIR037W 492 nt2.35□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 APQ13YJL075C 417 nt2.35□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 YMR320WYMR320W 306 nt2.35□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 YPL080CYPL080C 327 nt2.35□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 SIR3YLR442C 2937 nt2.35□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 VPS64YDR200C 1815 nt2.35□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 PES4YFR023W 1836 nt2.35□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 LAG1YHL003C 1236 nt2.34□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 YIL058WYIL058W 285 nt2.34□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 IST3YIR005W 447 nt2.34□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 PEP8YJL053W 1140 nt2.34□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 CSI1YMR025W 888 nt2.34□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 LCL1YPL056C 306 nt2.34□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 YPL276WYPL276W 438 nt2.34□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.34□□□□□ -2.03
SKO1Q02100 KRE33YNL132W 3171 nt2.34□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 CBF2YGR140W 2871 nt2.34□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 SPR3YGR059W 1539 nt2.33□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 INP53YOR109W 3324 nt2.33□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 TWF1YGR080W 999 nt2.33□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 CIC1YHR052W 1131 nt2.33□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 SYS1YJL004C 612 nt2.33□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 JIP3YLR331C 378 nt2.33□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 YPP1YGR198W 2454 nt2.33□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 SAK1YER129W 3429 nt2.33□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 VPS16YPL045W 2397 nt2.32□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 RRP12YPL012W 3687 nt2.32□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 YLR001CYLR001C 2589 nt2.32□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 PHO2YDL106C 1680 nt2.32□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 DPB11YJL090C 2295 nt2.32□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 snR70snR70 164 nt2.32□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 HNT1YDL125C 477 nt2.32□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 MET32YDR253C 576 nt2.32□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 IRC4YDR540C 540 nt2.32□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.32□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 TPM2YIL138C 486 nt2.32□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 VPS51YKR020W 495 nt2.32□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 IGO1YNL157W 507 nt2.32□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 TOA1YOR194C 861 nt2.32□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 YPL039WYPL039W 951 nt2.32□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 YBR277CYBR277C 402 nt2.32□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 AYT1YLL063C 1425 nt2.32□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 YHR078WYHR078W 1659 nt2.31□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 SDC1YDR469W 528 nt2.31□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.31□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.31□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.31□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.31□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.31□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.31□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 RAM2YKL019W 951 nt2.31□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 YKR033CYKR033C 426 nt2.31□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 PHO80YOL001W 882 nt2.31□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 Q0017Q0017 162 nt2.31□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 PRK1YIL095W 2433 nt2.31□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 SNU56YDR240C 1479 nt2.31□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 ROY1YMR258C 1662 nt2.31□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 PHR1YOR386W 1698 nt2.31□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 MSB2YGR014W 3921 nt2.31□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 SNU114YKL173W 3027 nt2.31□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 YDR220CYDR220C 294 nt2.3□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.3□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 TIM10YHR005C-A 282 nt2.3□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 YKL044WYKL044W 321 nt2.3□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 TRS20YBR254C 528 nt2.3□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 YPL216WYPL216W 3309 nt2.29□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 AAD16YFL057C 459 nt2.29□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 RPL14BYHL001W 417 nt2.29□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 CMS1YLR003C 876 nt2.29□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 YLR458WYLR458W 381 nt2.29□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 MGR1YCL044C 1254 nt2.29□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 YEL043WYEL043W 2871 nt2.29□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 YPL150WYPL150W 2706 nt2.28□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 YLR278CYLR278C 4026 nt2.28□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 SPC1YJR010C-A 285 nt2.28□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 URA10YMR271C 684 nt2.28□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 SVS1YPL163C 783 nt2.28□□□□□ -2.04
SKO1Q02100 UBR1YGR184C 5853 nt2.27□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 RGL1YPL066W 1440 nt2.27□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 BRO1YPL084W 2535 nt2.27□□□□□ -2.05
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