Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 KIN82YCR091W 2163 nt2.96□□□□□ -1.94
VFA1P40080 VAS1YGR094W 3315 nt2.96□□□□□ -1.94
VFA1P40080 ESL2YKR096W 3588 nt2.96□□□□□ -1.94
VFA1P40080 BMH2YDR099W 822 nt2.96□□□□□ -1.94
VFA1P40080 HPA3YEL066W 540 nt2.96□□□□□ -1.94
VFA1P40080 PNC1YGL037C 651 nt2.96□□□□□ -1.94
VFA1P40080 CRG1YHR209W 876 nt2.96□□□□□ -1.94
VFA1P40080 YBR032WYBR032W 303 nt2.96□□□□□ -1.94
VFA1P40080 NSL1YPL233W 651 nt2.96□□□□□ -1.94
VFA1P40080 MET5YJR137C 4329 nt2.96□□□□□ -1.94
VFA1P40080 PFF1YBR074W 2931 nt2.96□□□□□ -1.94
VFA1P40080 SIN3YOL004W 4611 nt2.96□□□□□ -1.94
VFA1P40080 TCB2YNL087W 3537 nt2.95□□□□□ -1.94
VFA1P40080 MDM32YOR147W 1869 nt2.95□□□□□ -1.94
VFA1P40080 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.95□□□□□ -1.94
VFA1P40080 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.95□□□□□ -1.94
VFA1P40080 RPL14BYHL001W 417 nt2.95□□□□□ -1.94
VFA1P40080 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.95□□□□□ -1.94
VFA1P40080 TPM2YIL138C 486 nt2.95□□□□□ -1.94
VFA1P40080 SWM2YNR004W 441 nt2.95□□□□□ -1.94
VFA1P40080 BNA4YBL098W 1383 nt2.95□□□□□ -1.94
VFA1P40080 YOL057WYOL057W 2136 nt2.95□□□□□ -1.94
VFA1P40080 POM152YMR129W 4014 nt2.95□□□□□ -1.94
VFA1P40080 YAT2YER024W 2772 nt2.95□□□□□ -1.94
VFA1P40080 RSE1YML049C 4086 nt2.94□□□□□ -1.94
VFA1P40080 SPO71YDR104C 3738 nt2.94□□□□□ -1.94
VFA1P40080 YAP6YDR259C 1152 nt2.94□□□□□ -1.94
VFA1P40080 DYN2YDR424C 279 nt2.94□□□□□ -1.94
VFA1P40080 IRC4YDR540C 540 nt2.94□□□□□ -1.94
VFA1P40080 GLC7YER133W 939 nt2.94□□□□□ -1.94
VFA1P40080 YJR023CYJR023C 402 nt2.94□□□□□ -1.94
VFA1P40080 RPL8BYLL045C 771 nt2.94□□□□□ -1.94
VFA1P40080 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.94□□□□□ -1.94
VFA1P40080 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.94□□□□□ -1.94
VFA1P40080 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.94□□□□□ -1.94
VFA1P40080 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.94□□□□□ -1.94
VFA1P40080 YMR141CYMR141C 309 nt2.94□□□□□ -1.94
VFA1P40080 SIP18YMR175W 240 nt2.94□□□□□ -1.94
VFA1P40080 PEP12YOR036W 867 nt2.94□□□□□ -1.94
VFA1P40080 DGK1YOR311C 873 nt2.94□□□□□ -1.94
VFA1P40080 COG3YER157W 2406 nt2.94□□□□□ -1.94
VFA1P40080 NPR1YNL183C 2373 nt2.94□□□□□ -1.94
VFA1P40080 PDC2YDR081C 2778 nt2.94□□□□□ -1.94
VFA1P40080 TFC1YBR123C 1950 nt2.93□□□□□ -1.94
VFA1P40080 CCT7YJL111W 1653 nt2.93□□□□□ -1.94
VFA1P40080 SWF1YDR126W 1011 nt2.93□□□□□ -1.94
VFA1P40080 YGL165CYGL165C 579 nt2.93□□□□□ -1.94
VFA1P40080 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt2.93□□□□□ -1.94
VFA1P40080 RRF1YHR038W 693 nt2.93□□□□□ -1.94
VFA1P40080 IRC19YLL033W 693 nt2.93□□□□□ -1.94
VFA1P40080 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt2.93□□□□□ -1.94
VFA1P40080 RPL37AYLR185W 267 nt2.93□□□□□ -1.94
VFA1P40080 YAR047CYAR047C 321 nt2.93□□□□□ -1.94
VFA1P40080 UNG1YML021C 1080 nt2.93□□□□□ -1.94
VFA1P40080 YML084WYML084W 309 nt2.93□□□□□ -1.94
VFA1P40080 PEX17YNL214W 600 nt2.93□□□□□ -1.94
VFA1P40080 YOR053WYOR053W 342 nt2.93□□□□□ -1.94
VFA1P40080 FUS1YCL027W 1539 nt2.93□□□□□ -1.94
VFA1P40080 RTT10YPL183C 3042 nt2.93□□□□□ -1.94
VFA1P40080 CAF120YNL278W 3183 nt2.92□□□□□ -1.94
VFA1P40080 ROY1YMR258C 1662 nt2.92□□□□□ -1.94
VFA1P40080 TIM11YDR322C-A 291 nt2.92□□□□□ -1.94
VFA1P40080 PEP8YJL053W 1140 nt2.92□□□□□ -1.94
VFA1P40080 CDC33YOL139C 642 nt2.92□□□□□ -1.94
VFA1P40080 YOR029WYOR029W 336 nt2.92□□□□□ -1.94
VFA1P40080 YBR285WYBR285W 435 nt2.92□□□□□ -1.94
VFA1P40080 YPL150WYPL150W 2706 nt2.91□□□□□ -1.94
VFA1P40080 RAX2YLR084C 3663 nt2.91□□□□□ -1.94
VFA1P40080 STE14YDR410C 720 nt2.91□□□□□ -1.94
VFA1P40080 RPS17BYDR447C 411 nt2.91□□□□□ -1.94
VFA1P40080 YKL066WYKL066W 444 nt2.91□□□□□ -1.94
VFA1P40080 URA10YMR271C 684 nt2.91□□□□□ -1.94
VFA1P40080 YOL134CYOL134C 390 nt2.91□□□□□ -1.94
VFA1P40080 TSC3YBR058C-A 243 nt2.91□□□□□ -1.94
VFA1P40080 IKI3YLR384C 4050 nt2.91□□□□□ -1.94
VFA1P40080 APC2YLR127C 2562 nt2.91□□□□□ -1.94
VFA1P40080 YNL034WYNL034W 1839 nt2.91□□□□□ -1.94
VFA1P40080 NAB3YPL190C 2409 nt2.9□□□□□ -1.94
VFA1P40080 DSE4YNR067C 3354 nt2.9□□□□□ -1.94
VFA1P40080 ORC1YML065W 2745 nt2.9□□□□□ -1.95
VFA1P40080 YDR250CYDR250C 276 nt2.9□□□□□ -1.95
VFA1P40080 YIR040CYIR040C 333 nt2.9□□□□□ -1.95
VFA1P40080 YBR012CYBR012C 420 nt2.9□□□□□ -1.95
VFA1P40080 ECM29YHL030W 5607 nt2.9□□□□□ -1.95
VFA1P40080 DYN1YKR054C 12279 nt2.9□□□□□ -1.95
VFA1P40080 AYT1YLL063C 1425 nt2.9□□□□□ -1.95
VFA1P40080 BCK1YJL095W 4437 nt2.9□□□□□ -1.95
VFA1P40080 DUF1YOL087C 3351 nt2.9□□□□□ -1.95
VFA1P40080 PSK1YAL017W 4071 nt2.9□□□□□ -1.95
VFA1P40080 RRM3YHR031C 2172 nt2.9□□□□□ -1.95
VFA1P40080 RUD3YOR216C 1455 nt2.9□□□□□ -1.95
VFA1P40080 RLF2YPR018W 1821 nt2.89□□□□□ -1.95
VFA1P40080 SEC7YDR170C 6030 nt2.89□□□□□ -1.95
VFA1P40080 ATG31YDR022C 591 nt2.89□□□□□ -1.95
VFA1P40080 GPI19YDR437W 423 nt2.89□□□□□ -1.95
VFA1P40080 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.89□□□□□ -1.95
VFA1P40080 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.89□□□□□ -1.95
VFA1P40080 YOR392WYOR392W 444 nt2.89□□□□□ -1.95
VFA1P40080 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.89□□□□□ -1.95
VFA1P40080 SLM6YBR266C 453 nt2.89□□□□□ -1.95
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