Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 YGR067CYGR067C 2415 nt2.47□□□□□ -2.01
AVT5P38176 YER137W-AYER137W-A 306 nt2.47□□□□□ -2.01
AVT5P38176 COX23YHR116W 456 nt2.47□□□□□ -2.01
AVT5P38176 YKL136WYKL136W 399 nt2.47□□□□□ -2.01
AVT5P38176 SWM2YNR004W 441 nt2.47□□□□□ -2.01
AVT5P38176 BOI1YBL085W 2943 nt2.47□□□□□ -2.01
AVT5P38176 AI2Q0055 2565 nt2.47□□□□□ -2.01
AVT5P38176 BPT1YLL015W 4680 nt2.46□□□□□ -2.02
AVT5P38176 PBS2YJL128C 2007 nt2.46□□□□□ -2.02
AVT5P38176 BFR1YOR198C 1413 nt2.46□□□□□ -2.02
AVT5P38176 CDC50YCR094W 1176 nt2.46□□□□□ -2.02
AVT5P38176 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.46□□□□□ -2.02
AVT5P38176 RNR4YGR180C 1038 nt2.46□□□□□ -2.02
AVT5P38176 YOL150CYOL150C 312 nt2.46□□□□□ -2.02
AVT5P38176 TSC3YBR058C-A 243 nt2.46□□□□□ -2.02
AVT5P38176 RNH70YGR276C 1662 nt2.46□□□□□ -2.02
AVT5P38176 NTO1YPR031W 2247 nt2.46□□□□□ -2.02
AVT5P38176 UTP13YLR222C 2454 nt2.46□□□□□ -2.02
AVT5P38176 ESC1YMR219W 4977 nt2.46□□□□□ -2.02
AVT5P38176 SKT5YBL061C 2091 nt2.45□□□□□ -2.02
AVT5P38176 TFB1YDR311W 1929 nt2.45□□□□□ -2.02
AVT5P38176 MOT1YPL082C 5604 nt2.45□□□□□ -2.02
AVT5P38176 FMP32YFL046W 624 nt2.45□□□□□ -2.02
AVT5P38176 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.45□□□□□ -2.02
AVT5P38176 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.45□□□□□ -2.02
AVT5P38176 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.45□□□□□ -2.02
AVT5P38176 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.45□□□□□ -2.02
AVT5P38176 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.45□□□□□ -2.02
AVT5P38176 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.45□□□□□ -2.02
AVT5P38176 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.45□□□□□ -2.02
AVT5P38176 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.45□□□□□ -2.02
AVT5P38176 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.45□□□□□ -2.02
AVT5P38176 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.45□□□□□ -2.02
AVT5P38176 PEP8YJL053W 1140 nt2.45□□□□□ -2.02
AVT5P38176 TEN1YLR010C 483 nt2.45□□□□□ -2.02
AVT5P38176 YLR434CYLR434C 384 nt2.45□□□□□ -2.02
AVT5P38176 LSM2YBL026W 288 nt2.45□□□□□ -2.02
AVT5P38176 HHT2YNL031C 411 nt2.45□□□□□ -2.02
AVT5P38176 snR42snR42 351 nt2.45□□□□□ -2.02
AVT5P38176 SRO77YBL106C 3033 nt2.45□□□□□ -2.02
AVT5P38176 SOK1YDR006C 2706 nt2.45□□□□□ -2.02
AVT5P38176 CAF120YNL278W 3183 nt2.45□□□□□ -2.02
AVT5P38176 YAT2YER024W 2772 nt2.44□□□□□ -2.02
AVT5P38176 SLP1YOR154W 1764 nt2.44□□□□□ -2.02
AVT5P38176 SDH7YDR511W 402 nt2.44□□□□□ -2.02
AVT5P38176 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.44□□□□□ -2.02
AVT5P38176 BAT1YHR208W 1182 nt2.44□□□□□ -2.02
AVT5P38176 YML009C-AYML009C-A 327 nt2.44□□□□□ -2.02
AVT5P38176 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.44□□□□□ -2.02
AVT5P38176 YNL179CYNL179C 438 nt2.44□□□□□ -2.02
AVT5P38176 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt2.44□□□□□ -2.02
AVT5P38176 YOR385WYOR385W 873 nt2.44□□□□□ -2.02
AVT5P38176 YPL039WYPL039W 951 nt2.44□□□□□ -2.02
AVT5P38176 SSP1YHR184W 1716 nt2.44□□□□□ -2.02
AVT5P38176 YKL222CYKL222C 2118 nt2.44□□□□□ -2.02
AVT5P38176 YJR098CYJR098C 1971 nt2.43□□□□□ -2.02
AVT5P38176 DSE4YNR067C 3354 nt2.43□□□□□ -2.02
AVT5P38176 YDR090CYDR090C 933 nt2.43□□□□□ -2.02
AVT5P38176 YGL165CYGL165C 579 nt2.43□□□□□ -2.02
AVT5P38176 YIL012WYIL012W 342 nt2.43□□□□□ -2.02
AVT5P38176 CGI121YML036W 546 nt2.43□□□□□ -2.02
AVT5P38176 HSP10YOR020C 321 nt2.43□□□□□ -2.02
AVT5P38176 FMP23YBR047W 528 nt2.43□□□□□ -2.02
AVT5P38176 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt2.43□□□□□ -2.02
AVT5P38176 RTT10YPL183C 3042 nt2.43□□□□□ -2.02
AVT5P38176 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.42□□□□□ -2.02
AVT5P38176 YCR022CYCR022C 345 nt2.42□□□□□ -2.02
AVT5P38176 TWF1YGR080W 999 nt2.42□□□□□ -2.02
AVT5P38176 VOA1YGR106C 798 nt2.42□□□□□ -2.02
AVT5P38176 YIL054WYIL054W 318 nt2.42□□□□□ -2.02
AVT5P38176 ZEO1YOL109W 342 nt2.42□□□□□ -2.02
AVT5P38176 PEP12YOR036W 867 nt2.42□□□□□ -2.02
AVT5P38176 ALY1YKR021W 2748 nt2.42□□□□□ -2.02
AVT5P38176 RGC1YPR115W 3252 nt2.42□□□□□ -2.02
AVT5P38176 PUF6YDR496C 1971 nt2.41□□□□□ -2.02
AVT5P38176 FAA2YER015W 2235 nt2.41□□□□□ -2.02
AVT5P38176 SEC7YDR170C 6030 nt2.41□□□□□ -2.02
AVT5P38176 HYP2YEL034W 474 nt2.41□□□□□ -2.02
AVT5P38176 RPS26BYER131W 360 nt2.41□□□□□ -2.02
AVT5P38176 YIL174WYIL174W 228 nt2.41□□□□□ -2.02
AVT5P38176 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.41□□□□□ -2.02
AVT5P38176 ABM1YJR108W 372 nt2.41□□□□□ -2.02
AVT5P38176 RPL6AYML073C 531 nt2.41□□□□□ -2.02
AVT5P38176 ROY1YMR258C 1662 nt2.41□□□□□ -2.02
AVT5P38176 ECM29YHL030W 5607 nt2.4□□□□□ -2.02
AVT5P38176 NMA111YNL123W 2994 nt2.4□□□□□ -2.02
AVT5P38176 RGR1YLR071C 3249 nt2.4□□□□□ -2.02
AVT5P38176 PSK1YAL017W 4071 nt2.4□□□□□ -2.02
AVT5P38176 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.4□□□□□ -2.03
AVT5P38176 YDR366CYDR366C 399 nt2.4□□□□□ -2.03
AVT5P38176 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.4□□□□□ -2.03
AVT5P38176 RAD6YGL058W 519 nt2.4□□□□□ -2.03
AVT5P38176 YGR035CYGR035C 351 nt2.4□□□□□ -2.03
AVT5P38176 YHL005CYHL005C 393 nt2.4□□□□□ -2.03
AVT5P38176 RPS24BYIL069C 408 nt2.4□□□□□ -2.03
AVT5P38176 MRPL31YKL138C 396 nt2.4□□□□□ -2.03
AVT5P38176 COQ10YOL008W 624 nt2.4□□□□□ -2.03
AVT5P38176 YOR121CYOR121C 306 nt2.4□□□□□ -2.03
AVT5P38176 HEM4YOR278W 828 nt2.4□□□□□ -2.03
AVT5P38176 YPR014CYPR014C 330 nt2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.8 ms