Protein–RNA interactions for Protein: P34220

YBL055C, Deoxyribonuclease Tat-D, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL055CP34220 YPL080CYPL080C 327 nt2.66□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 TRM2YKR056W 1920 nt2.66□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 TIF35YDR429C 825 nt2.65□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 FYV4YHR059W 393 nt2.65□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.65□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 YLR171WYLR171W 390 nt2.65□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 CTK3YML112W 891 nt2.65□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 ISU1YPL135W 498 nt2.65□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 NSL1YPL233W 651 nt2.65□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 RLF2YPR018W 1821 nt2.65□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 ARP8YOR141C 2646 nt2.65□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 VAC8YEL013W 1737 nt2.65□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 YLR001CYLR001C 2589 nt2.64□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 DUG2YBR281C 2637 nt2.64□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 ESC1YMR219W 4977 nt2.64□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 SIN3YOL004W 4611 nt2.64□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.64□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 RPI1YIL119C 1224 nt2.64□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt2.64□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 DDR48YMR173W 1293 nt2.64□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 ESF2YNR054C 951 nt2.64□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 YOR055WYOR055W 435 nt2.64□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 SKP2YNL311C 2292 nt2.64□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 GEA1YJR031C 4227 nt2.64□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 FIR1YER032W 2631 nt2.63□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 TSA2YDR453C 591 nt2.63□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 YER084W-AYER084W-A 513 nt2.63□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 BI2Q0110 1272 nt2.63□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 TOM22YNL131W 459 nt2.63□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 YKR078WYKR078W 1758 nt2.63□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 RPS17BYDR447C 411 nt2.62□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.62□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 BIG1YHR101C 1008 nt2.62□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt2.62□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 NOP15YNL110C 663 nt2.62□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 YPL039WYPL039W 951 nt2.62□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 IRC16YPR038W 360 nt2.62□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 UTP13YLR222C 2454 nt2.62□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 SLH1YGR271W 5904 nt2.61□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.61□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 PKR1YMR123W 369 nt2.61□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 RRT1YBL048W 312 nt2.61□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 YNL324WYNL324W 396 nt2.61□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 YOR050CYOR050C 348 nt2.61□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 RPB5YBR154C 648 nt2.61□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 BNR1YIL159W 4128 nt2.61□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 DNA2YHR164C 4569 nt2.61□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 SKT5YBL061C 2091 nt2.61□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 FKS3YMR306W 5358 nt2.6□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 NUM1YDR150W 8247 nt2.6□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 NPR3YHL023C 3441 nt2.6□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.6□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 YGR042WYGR042W 816 nt2.6□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 RTS3YGR161C 792 nt2.6□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 SWM2YNR004W 441 nt2.6□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.6□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 SUL1YBR294W 2580 nt2.6□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 PRP8YHR165C 7242 nt2.6□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 GCV2YMR189W 3105 nt2.6□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 PUF4YGL014W 2667 nt2.59□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 YNL034WYNL034W 1839 nt2.59□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.59□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.59□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 ADK1YDR226W 669 nt2.59□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 GPI19YDR437W 423 nt2.59□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 LAG1YHL003C 1236 nt2.59□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.59□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 snR41snR41 95 nt2.59□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 YIL166CYIL166C 1629 nt2.59□□□□□ -1.99
YBL055CP34220 MLH1YMR167W 2310 nt2.59□□□□□ -2
YBL055CP34220 ECM5YMR176W 4236 nt2.58□□□□□ -2
YBL055CP34220 IRC4YDR540C 540 nt2.58□□□□□ -2
YBL055CP34220 SMB1YER029C 591 nt2.58□□□□□ -2
YBL055CP34220 YER189WYER189W 369 nt2.58□□□□□ -2
YBL055CP34220 RNR4YGR180C 1038 nt2.58□□□□□ -2
YBL055CP34220 YML108WYML108W 318 nt2.58□□□□□ -2
YBL055CP34220 LEU3YLR451W 2661 nt2.58□□□□□ -2
YBL055CP34220 DPB11YJL090C 2295 nt2.58□□□□□ -2
YBL055CP34220 MUD2YKL074C 1584 nt2.57□□□□□ -2
YBL055CP34220 GDS1YOR355W 1569 nt2.57□□□□□ -2
YBL055CP34220 MMS1YPR164W 4224 nt2.57□□□□□ -2
YBL055CP34220 YPS5YGL259W 498 nt2.57□□□□□ -2
YBL055CP34220 ECL1YGR146C 636 nt2.57□□□□□ -2
YBL055CP34220 NOP19YGR251W 591 nt2.57□□□□□ -2
YBL055CP34220 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.57□□□□□ -2
YBL055CP34220 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.57□□□□□ -2
YBL055CP34220 AIM29YKR074W 468 nt2.57□□□□□ -2
YBL055CP34220 CMS1YLR003C 876 nt2.57□□□□□ -2
YBL055CP34220 COQ10YOL008W 624 nt2.57□□□□□ -2
YBL055CP34220 PSK2YOL045W 3306 nt2.57□□□□□ -2
YBL055CP34220 SPE1YKL184W 1401 nt2.57□□□□□ -2
YBL055CP34220 SLN1YIL147C 3663 nt2.56□□□□□ -2
YBL055CP34220 YJR023CYJR023C 402 nt2.56□□□□□ -2
YBL055CP34220 RMP1YLR145W 606 nt2.56□□□□□ -2
YBL055CP34220 MRPL33YMR286W 261 nt2.56□□□□□ -2
YBL055CP34220 PRM3YPL192C 402 nt2.56□□□□□ -2
YBL055CP34220 YPL197CYPL197C 414 nt2.56□□□□□ -2
YBL055CP34220 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.56□□□□□ -2
YBL055CP34220 GCD10YNL062C 1437 nt2.56□□□□□ -2
YBL055CP34220 GPI17YDR434W 1605 nt2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.8 ms