Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL2P13500 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL2P13500 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL2P13500 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL2P13500 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL2P13500 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL2P13500 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL2P13500 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL2P13500 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL2P13500 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL2P13500 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL2P13500 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL2P13500 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL2P13500 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL2P13500 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL2P13500 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL2P13500 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL2P13500 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL2P13500 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL2P13500 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL2P13500 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL2P13500 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL2P13500 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL2P13500 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL2P13500 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL2P13500 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL2P13500 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL2P13500 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL2P13500 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL2P13500 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL2P13500 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL2P13500 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL2P13500 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL2P13500 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL2P13500 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL2P13500 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL2P13500 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL2P13500 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL2P13500 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL2P13500 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL2P13500 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL2P13500 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL2P13500 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL2P13500 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL2P13500 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL2P13500 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL2P13500 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL2P13500 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL2P13500 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL2P13500 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL2P13500 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL2P13500 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL2P13500 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL2P13500 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL2P13500 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL2P13500 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL2P13500 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL2P13500 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL2P13500 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL2P13500 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL2P13500 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL2P13500 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL2P13500 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL2P13500 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL2P13500 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL2P13500 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL2P13500 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL2P13500 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL2P13500 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL2P13500 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL2P13500 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL2P13500 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL2P13500 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL2P13500 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL2P13500 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL2P13500 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL2P13500 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL2P13500 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL2P13500 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL2P13500 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL2P13500 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL2P13500 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL2P13500 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL2P13500 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL2P13500 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL2P13500 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL2P13500 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL2P13500 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL2P13500 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL2P13500 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL2P13500 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL2P13500 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL2P13500 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL2P13500 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL2P13500 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL2P13500 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL2P13500 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL2P13500 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL2P13500 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL2P13500 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms