Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms