Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 TIM12YBR091C 330 nt2.99□□□□□ -1.93
HER1Q12276 SWD3YBR175W 948 nt2.99□□□□□ -1.93
HER1Q12276 UBP14YBR058C 2346 nt2.99□□□□□ -1.93
HER1Q12276 TAO3YIL129C 7131 nt2.99□□□□□ -1.93
HER1Q12276 YKL100CYKL100C 1764 nt2.99□□□□□ -1.93
HER1Q12276 CHO2YGR157W 2610 nt2.99□□□□□ -1.93
HER1Q12276 SKP2YNL311C 2292 nt2.99□□□□□ -1.93
HER1Q12276 HBT1YDL223C 3141 nt2.99□□□□□ -1.93
HER1Q12276 VAC8YEL013W 1737 nt2.99□□□□□ -1.93
HER1Q12276 MUB1YMR100W 1863 nt2.99□□□□□ -1.93
HER1Q12276 YNR063WYNR063W 1824 nt2.98□□□□□ -1.93
HER1Q12276 BUD4YJR092W 4344 nt2.98□□□□□ -1.93
HER1Q12276 YDR338CYDR338C 2088 nt2.98□□□□□ -1.93
HER1Q12276 COX8YLR395C 237 nt2.98□□□□□ -1.93
HER1Q12276 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.98□□□□□ -1.93
HER1Q12276 PEP12YOR036W 867 nt2.98□□□□□ -1.93
HER1Q12276 YOR277CYOR277C 309 nt2.98□□□□□ -1.93
HER1Q12276 YAT2YER024W 2772 nt2.98□□□□□ -1.93
HER1Q12276 DSE4YNR067C 3354 nt2.98□□□□□ -1.93
HER1Q12276 YCK2YNL154C 1641 nt2.97□□□□□ -1.93
HER1Q12276 YLR278CYLR278C 4026 nt2.97□□□□□ -1.93
HER1Q12276 SEN54YPL083C 1404 nt2.97□□□□□ -1.93
HER1Q12276 YDR366CYDR366C 399 nt2.97□□□□□ -1.93
HER1Q12276 DFG10YIL049W 762 nt2.97□□□□□ -1.93
HER1Q12276 LSM8YJR022W 330 nt2.97□□□□□ -1.93
HER1Q12276 YJR079WYJR079W 330 nt2.97□□□□□ -1.93
HER1Q12276 CWC24YLR323C 780 nt2.97□□□□□ -1.93
HER1Q12276 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.97□□□□□ -1.93
HER1Q12276 CDC33YOL139C 642 nt2.97□□□□□ -1.93
HER1Q12276 RRD2YPL152W 1077 nt2.97□□□□□ -1.93
HER1Q12276 PIS1YPR113W 663 nt2.97□□□□□ -1.93
HER1Q12276 PCK1YKR097W 1650 nt2.97□□□□□ -1.93
HER1Q12276 KAP104YBR017C 2757 nt2.97□□□□□ -1.93
HER1Q12276 MAK5YBR142W 2322 nt2.97□□□□□ -1.93
HER1Q12276 NET1YJL076W 3570 nt2.96□□□□□ -1.93
HER1Q12276 YTA7YGR270W 4140 nt2.96□□□□□ -1.94
HER1Q12276 RRM3YHR031C 2172 nt2.96□□□□□ -1.94
HER1Q12276 YCR022CYCR022C 345 nt2.96□□□□□ -1.94
HER1Q12276 SDC1YDR469W 528 nt2.96□□□□□ -1.94
HER1Q12276 TCD1YHR003C 1290 nt2.96□□□□□ -1.94
HER1Q12276 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt2.96□□□□□ -1.94
HER1Q12276 COQ10YOL008W 624 nt2.96□□□□□ -1.94
HER1Q12276 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt2.96□□□□□ -1.94
HER1Q12276 VHR2YER064C 1518 nt2.96□□□□□ -1.94
HER1Q12276 RCY1YJL204C 2523 nt2.96□□□□□ -1.94
HER1Q12276 MSH4YFL003C 2637 nt2.96□□□□□ -1.94
HER1Q12276 FRE8YLR047C 2061 nt2.96□□□□□ -1.94
HER1Q12276 ITC1YGL133W 3795 nt2.96□□□□□ -1.94
HER1Q12276 GPI17YDR434W 1605 nt2.95□□□□□ -1.94
HER1Q12276 DYN2YDR424C 279 nt2.95□□□□□ -1.94
HER1Q12276 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.95□□□□□ -1.94
HER1Q12276 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.95□□□□□ -1.94
HER1Q12276 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.95□□□□□ -1.94
HER1Q12276 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.95□□□□□ -1.94
HER1Q12276 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.95□□□□□ -1.94
HER1Q12276 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.95□□□□□ -1.94
HER1Q12276 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.95□□□□□ -1.94
HER1Q12276 YGR053CYGR053C 852 nt2.95□□□□□ -1.94
HER1Q12276 ABM1YJR108W 372 nt2.95□□□□□ -1.94
HER1Q12276 YKL083WYKL083W 615 nt2.95□□□□□ -1.94
HER1Q12276 RMP1YLR145W 606 nt2.95□□□□□ -1.94
HER1Q12276 YLR434CYLR434C 384 nt2.95□□□□□ -1.94
HER1Q12276 RPL20AYMR242C 519 nt2.95□□□□□ -1.94
HER1Q12276 YNL043CYNL043C 321 nt2.95□□□□□ -1.94
HER1Q12276 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt2.95□□□□□ -1.94
HER1Q12276 ATG13YPR185W 2217 nt2.95□□□□□ -1.94
HER1Q12276 YDR061WYDR061W 1620 nt2.94□□□□□ -1.94
HER1Q12276 CDC26YFR036W 375 nt2.94□□□□□ -1.94
HER1Q12276 YGR035CYGR035C 351 nt2.94□□□□□ -1.94
HER1Q12276 TEN1YLR010C 483 nt2.94□□□□□ -1.94
HER1Q12276 APC9YLR102C 798 nt2.94□□□□□ -1.94
HER1Q12276 YAR053WYAR053W 297 nt2.94□□□□□ -1.94
HER1Q12276 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt2.94□□□□□ -1.94
HER1Q12276 YJR098CYJR098C 1971 nt2.94□□□□□ -1.94
HER1Q12276 SPO14YKR031C 5052 nt2.94□□□□□ -1.94
HER1Q12276 PMR1YGL167C 2853 nt2.94□□□□□ -1.94
HER1Q12276 BFR1YOR198C 1413 nt2.93□□□□□ -1.94
HER1Q12276 GCD6YDR211W 2139 nt2.93□□□□□ -1.94
HER1Q12276 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.93□□□□□ -1.94
HER1Q12276 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.93□□□□□ -1.94
HER1Q12276 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.93□□□□□ -1.94
HER1Q12276 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.93□□□□□ -1.94
HER1Q12276 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.93□□□□□ -1.94
HER1Q12276 YCL019WYCL019W 5313 nt2.93□□□□□ -1.94
HER1Q12276 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.93□□□□□ -1.94
HER1Q12276 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.93□□□□□ -1.94
HER1Q12276 YGL042CYGL042C 306 nt2.93□□□□□ -1.94
HER1Q12276 YGR242WYGR242W 309 nt2.93□□□□□ -1.94
HER1Q12276 OTU2YHL013C 924 nt2.93□□□□□ -1.94
HER1Q12276 MBB1YJL199C 327 nt2.93□□□□□ -1.94
HER1Q12276 CCT7YJL111W 1653 nt2.92□□□□□ -1.94
HER1Q12276 STN1YDR082W 1485 nt2.92□□□□□ -1.94
HER1Q12276 INP52YNL106C 3552 nt2.92□□□□□ -1.94
HER1Q12276 SDH7YDR511W 402 nt2.92□□□□□ -1.94
HER1Q12276 YER137W-AYER137W-A 306 nt2.92□□□□□ -1.94
HER1Q12276 VEL1YGL258W 621 nt2.92□□□□□ -1.94
HER1Q12276 FYV4YHR059W 393 nt2.92□□□□□ -1.94
HER1Q12276 MAM33YIL070C 801 nt2.92□□□□□ -1.94
HER1Q12276 YKL118WYKL118W 312 nt2.92□□□□□ -1.94
HER1Q12276 MRPL31YKL138C 396 nt2.92□□□□□ -1.94
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