Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.53□□□□□ -2
VPS54Q12071 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.53□□□□□ -2
VPS54Q12071 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.53□□□□□ -2
VPS54Q12071 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.53□□□□□ -2
VPS54Q12071 IRC2YDR112W 309 nt2.53□□□□□ -2
VPS54Q12071 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.53□□□□□ -2
VPS54Q12071 PRP38YGR075C 729 nt2.53□□□□□ -2
VPS54Q12071 SDL1YIL167W 633 nt2.53□□□□□ -2
VPS54Q12071 YNL150WYNL150W 408 nt2.53□□□□□ -2
VPS54Q12071 MPP6YNR024W 561 nt2.53□□□□□ -2
VPS54Q12071 MIX23YBL107C 591 nt2.53□□□□□ -2
VPS54Q12071 SRL4YPL033C 846 nt2.53□□□□□ -2
VPS54Q12071 MUD1YBR119W 897 nt2.53□□□□□ -2
VPS54Q12071 AMS1YGL156W 3252 nt2.53□□□□□ -2
VPS54Q12071 TPS2YDR074W 2691 nt2.53□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 MSB1YOR188W 3414 nt2.52□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 PAU14YIL176C 363 nt2.52□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 YJL119CYJL119C 324 nt2.52□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 PAU1YJL223C 363 nt2.52□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 PSY1YKL076C 384 nt2.52□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 ATP18YML081C-A 180 nt2.52□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 YMR187CYMR187C 1296 nt2.52□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 CRS5YOR031W 210 nt2.52□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 PEP12YOR036W 867 nt2.52□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 ISU1YPL135W 498 nt2.52□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 CSM4YPL200W 471 nt2.52□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 YIL166CYIL166C 1629 nt2.52□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 SWA2YDR320C 2007 nt2.52□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 GDI1YER136W 1356 nt2.51□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 snR5snR5 204 nt2.51□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 RPS17BYDR447C 411 nt2.51□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 YJR087WYJR087W 351 nt2.51□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 YKL123WYKL123W 381 nt2.51□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 RNP1YLL046C 750 nt2.51□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 YNL179CYNL179C 438 nt2.51□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 YOR364WYOR364W 369 nt2.51□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 STE11YLR362W 2154 nt2.51□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 MRD1YPR112C 2664 nt2.51□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 VTC3YPL019C 2508 nt2.5□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 TMN3YER113C 2121 nt2.5□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 GAL80YML051W 1308 nt2.5□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 snR9snR9 187 nt2.5□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 GLC7YER133W 939 nt2.5□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 RTS3YGR161C 792 nt2.5□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.5□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 TMA10YLR327C 261 nt2.5□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 RPL36AYMR194W 303 nt2.5□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 KTI11YBL071W-A 249 nt2.5□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 RIO2YNL207W 1278 nt2.5□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 TAZ1YPR140W 1146 nt2.5□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 SNF12YNR023W 1701 nt2.5□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 SAK1YER129W 3429 nt2.5□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 GPI17YDR434W 1605 nt2.5□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 OSW7YFR039C 1533 nt2.49□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 UBP15YMR304W 3693 nt2.49□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 TIF35YDR429C 825 nt2.49□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 VMA21YGR105W 234 nt2.49□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 YJL202CYJL202C 348 nt2.49□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.49□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 TAP42YMR028W 1101 nt2.49□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 ALG14YBR070C 714 nt2.49□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 YPR147CYPR147C 915 nt2.49□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 ARR2YPR200C 393 nt2.49□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 MLH1YMR167W 2310 nt2.49□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 SCP160YJL080C 3669 nt2.49□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 VPS74YDR372C 1038 nt2.48□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 YGR293CYGR293C 462 nt2.48□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 PDP3YLR455W 915 nt2.48□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 YNR021WYNR021W 1215 nt2.48□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 YNR025CYNR025C 360 nt2.48□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 OST2YOR103C 393 nt2.48□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 SPF1YEL031W 3648 nt2.48□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 HRD3YLR207W 2502 nt2.48□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 SGS1YMR190C 4344 nt2.48□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 EDS1YBR033W 2760 nt2.48□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 PHO2YDL106C 1680 nt2.47□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 SMC6YLR383W 3345 nt2.47□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 YDL009CYDL009C 324 nt2.47□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 OCA6YDR067C 675 nt2.47□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 YDR537CYDR537C 606 nt2.47□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 YGR228WYGR228W 345 nt2.47□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 CKA1YIL035C 1119 nt2.47□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 CSE4YKL049C 690 nt2.47□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 VPH2YKL119C 648 nt2.47□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 YMR144WYMR144W 1029 nt2.47□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 YBL108WYBL108W 306 nt2.47□□□□□ -2.01
VPS54Q12071 PDR11YIL013C 4236 nt2.46□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 BAS1YKR099W 2436 nt2.46□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 YCR064CYCR064C 411 nt2.46□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 NCB2YDR397C 441 nt2.46□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt2.46□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 YGL042CYGL042C 306 nt2.46□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 LRP1YHR081W 555 nt2.46□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt2.46□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 YMR254CYMR254C 309 nt2.46□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 YOL150CYOL150C 312 nt2.46□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 JID1YPR061C 906 nt2.46□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 YBR209WYBR209W 318 nt2.46□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 INP51YIL002C 2841 nt2.46□□□□□ -2.02
VPS54Q12071 PSO2YMR137C 1986 nt2.45□□□□□ -2.02
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