Protein–RNA interactions for Protein: Q07834

YLL032C, KH domain-containing protein YLL032C, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL032CQ07834 TOP2YNL088W 4287 nt2.66□□□□□ -1.98
YLL032CQ07834 YMR31YFR049W 372 nt2.66□□□□□ -1.98
YLL032CQ07834 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.66□□□□□ -1.98
YLL032CQ07834 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.66□□□□□ -1.98
YLL032CQ07834 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.66□□□□□ -1.98
YLL032CQ07834 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.66□□□□□ -1.98
YLL032CQ07834 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.66□□□□□ -1.98
YLL032CQ07834 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.66□□□□□ -1.98
YLL032CQ07834 MRP49YKL167C 414 nt2.66□□□□□ -1.98
YLL032CQ07834 FUS1YCL027W 1539 nt2.66□□□□□ -1.98
YLL032CQ07834 DNL4YOR005C 2835 nt2.65□□□□□ -1.98
YLL032CQ07834 RPS26BYER131W 360 nt2.65□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 MPO1YGL010W 525 nt2.65□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 CIC1YHR052W 1131 nt2.65□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 NYV1YLR093C 762 nt2.65□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 YMR144WYMR144W 1029 nt2.65□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 FPR1YNL135C 345 nt2.65□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 YOR364WYOR364W 369 nt2.65□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 ISU1YPL135W 498 nt2.65□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 YPR014CYPR014C 330 nt2.65□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 SHE9YDR393W 1371 nt2.64□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 AXL1YPR122W 3627 nt2.64□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 ISW1YBR245C 3390 nt2.64□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 YDL009CYDL009C 324 nt2.64□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 MET32YDR253C 576 nt2.64□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 YGR290WYGR290W 444 nt2.64□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 OTU2YHL013C 924 nt2.64□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 SYS1YJL004C 612 nt2.64□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 EAF6YJR082C 342 nt2.64□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 YKR051WYKR051W 1257 nt2.64□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 YLR252WYLR252W 306 nt2.64□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 BER1YLR412W 825 nt2.64□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.64□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 OST2YOR103C 393 nt2.64□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 IKI3YLR384C 4050 nt2.63□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 BFR1YOR198C 1413 nt2.63□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 YIR020CYIR020C 303 nt2.63□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 BET4YJL031C 984 nt2.63□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 VID24YBR105C 1089 nt2.63□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 FKS3YMR306W 5358 nt2.63□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.62□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 DAL5YJR152W 1632 nt2.62□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 YPL150WYPL150W 2706 nt2.62□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 PRM8YGL053W 714 nt2.62□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 RPL14BYHL001W 417 nt2.62□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 GAL7YBR018C 1101 nt2.62□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 YPR096CYPR096C 303 nt2.62□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 SMY2YBR172C 2223 nt2.62□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 AMS1YGL156W 3252 nt2.62□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 SSF1YHR066W 1362 nt2.61□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 RLF2YPR018W 1821 nt2.61□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 YKU80YMR106C 1890 nt2.61□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.61□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 snR76snR76 109 nt2.61□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 RTS3YGR161C 792 nt2.61□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 DFG10YIL049W 762 nt2.61□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 AFB1YLR040C 675 nt2.61□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 HRI1YLR301W 735 nt2.61□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 JIP3YLR331C 378 nt2.61□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 RPS29AYLR388W 171 nt2.61□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2.61□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 PHO80YOL001W 882 nt2.61□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 CRS5YOR031W 210 nt2.61□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.61□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.61□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 NPR3YHL023C 3441 nt2.61□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 FAR11YNL127W 2862 nt2.61□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 SDC25YLL016W 3147 nt2.61□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 SIP3YNL257C 3690 nt2.61□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 YLR001CYLR001C 2589 nt2.6□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 SGS1YMR190C 4344 nt2.6□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 COG3YER157W 2406 nt2.6□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 PUF4YGL014W 2667 nt2.6□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 HNT1YDL125C 477 nt2.6□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 YDR220CYDR220C 294 nt2.6□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 SPO13YHR014W 876 nt2.6□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt2.6□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 ESF2YNR054C 951 nt2.6□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 ALG14YBR070C 714 nt2.6□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 snR43snR43 209 nt2.6□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 TRA1YHR099W 11235 nt2.6□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 ESL2YKR096W 3588 nt2.6□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 TRZ1YKR079C 2517 nt2.6□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 PDR3YBL005W 2931 nt2.59□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 ESC1YMR219W 4977 nt2.59□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 YGL015CYGL015C 393 nt2.59□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 YGL042CYGL042C 306 nt2.59□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 VPS51YKR020W 495 nt2.59□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 YOL150CYOL150C 312 nt2.59□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 TOA1YOR194C 861 nt2.59□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 BI4Q0120 1917 nt2.59□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 SWR1YDR334W 4545 nt2.59□□□□□ -1.99
YLL032CQ07834 YDR239CYDR239C 2364 nt2.59□□□□□ -2
YLL032CQ07834 ORC2YBR060C 1863 nt2.58□□□□□ -2
YLL032CQ07834 YIL080WYIL080W 4722 nt2.58□□□□□ -2
YLL032CQ07834 SWA2YDR320C 2007 nt2.58□□□□□ -2
YLL032CQ07834 YDR199WYDR199W 366 nt2.58□□□□□ -2
YLL032CQ07834 YEL057CYEL057C 702 nt2.58□□□□□ -2
YLL032CQ07834 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.58□□□□□ -2
YLL032CQ07834 YNL122CYNL122C 348 nt2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 65.4 ms