Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 HSP10YOR020C 321 nt3.06□□□□□ -1.92
VFA1P40080 MSS18YPR134W 807 nt3.06□□□□□ -1.92
VFA1P40080 UTP13YLR222C 2454 nt3.05□□□□□ -1.92
VFA1P40080 YAK1YJL141C 2424 nt3.05□□□□□ -1.92
VFA1P40080 BFR1YOR198C 1413 nt3.05□□□□□ -1.92
VFA1P40080 YER079WYER079W 633 nt3.05□□□□□ -1.92
VFA1P40080 TCD1YHR003C 1290 nt3.05□□□□□ -1.92
VFA1P40080 RPS22AYJL190C 393 nt3.05□□□□□ -1.92
VFA1P40080 YLR230WYLR230W 306 nt3.05□□□□□ -1.92
VFA1P40080 TIF11YMR260C 462 nt3.05□□□□□ -1.92
VFA1P40080 YNL043CYNL043C 321 nt3.05□□□□□ -1.92
VFA1P40080 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt3.04□□□□□ -1.92
VFA1P40080 YER135CYER135C 393 nt3.04□□□□□ -1.92
VFA1P40080 YPS5YGL259W 498 nt3.04□□□□□ -1.92
VFA1P40080 YLR012CYLR012C 300 nt3.04□□□□□ -1.92
VFA1P40080 YBL065WYBL065W 345 nt3.04□□□□□ -1.92
VFA1P40080 YPL080CYPL080C 327 nt3.04□□□□□ -1.92
VFA1P40080 CWC22YGR278W 1734 nt3.04□□□□□ -1.92
VFA1P40080 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt3.04□□□□□ -1.92
VFA1P40080 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt3.04□□□□□ -1.92
VFA1P40080 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt3.04□□□□□ -1.92
VFA1P40080 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt3.04□□□□□ -1.92
VFA1P40080 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt3.04□□□□□ -1.92
VFA1P40080 YCL019WYCL019W 5313 nt3.04□□□□□ -1.92
VFA1P40080 VHR2YER064C 1518 nt3.03□□□□□ -1.92
VFA1P40080 ESL1YIL151C 3357 nt3.03□□□□□ -1.92
VFA1P40080 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt3.03□□□□□ -1.92
VFA1P40080 TOM70YNL121C 1854 nt3.03□□□□□ -1.92
VFA1P40080 CDH1YGL003C 1701 nt3.03□□□□□ -1.92
VFA1P40080 SNF12YNR023W 1701 nt3.03□□□□□ -1.92
VFA1P40080 APC11YDL008W 498 nt3.03□□□□□ -1.92
VFA1P40080 RMP1YLR145W 606 nt3.03□□□□□ -1.92
VFA1P40080 YKL100CYKL100C 1764 nt3.02□□□□□ -1.93
VFA1P40080 MED1YPR070W 1701 nt3.02□□□□□ -1.93
VFA1P40080 EXO84YBR102C 2262 nt3.02□□□□□ -1.93
VFA1P40080 YDR269CYDR269C 324 nt3.02□□□□□ -1.93
VFA1P40080 YDR431WYDR431W 312 nt3.02□□□□□ -1.93
VFA1P40080 RAD6YGL058W 519 nt3.02□□□□□ -1.93
VFA1P40080 YHR138CYHR138C 345 nt3.02□□□□□ -1.93
VFA1P40080 YKR033CYKR033C 426 nt3.02□□□□□ -1.93
VFA1P40080 YOL159CYOL159C 516 nt3.02□□□□□ -1.93
VFA1P40080 BUD4YJR092W 4344 nt3.02□□□□□ -1.93
VFA1P40080 TSC11YER093C 4293 nt3.02□□□□□ -1.93
VFA1P40080 FLO1YAR050W 4614 nt3.01□□□□□ -1.93
VFA1P40080 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt3.01□□□□□ -1.93
VFA1P40080 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt3.01□□□□□ -1.93
VFA1P40080 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt3.01□□□□□ -1.93
VFA1P40080 CDC20YGL116W 1833 nt3.01□□□□□ -1.93
VFA1P40080 SMB1YER029C 591 nt3.01□□□□□ -1.93
VFA1P40080 LAG1YHL003C 1236 nt3.01□□□□□ -1.93
VFA1P40080 CMS1YLR003C 876 nt3.01□□□□□ -1.93
VFA1P40080 YLR269CYLR269C 351 nt3.01□□□□□ -1.93
VFA1P40080 ISU1YPL135W 498 nt3.01□□□□□ -1.93
VFA1P40080 BOI1YBL085W 2943 nt3□□□□□ -1.93
VFA1P40080 YLR001CYLR001C 2589 nt3□□□□□ -1.93
VFA1P40080 DBP10YDL031W 2988 nt3□□□□□ -1.93
VFA1P40080 YER087C-AYER087C-A 552 nt3□□□□□ -1.93
VFA1P40080 ERP6YGL002W 651 nt3□□□□□ -1.93
VFA1P40080 RNR4YGR180C 1038 nt3□□□□□ -1.93
VFA1P40080 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt3□□□□□ -1.93
VFA1P40080 JIP3YLR331C 378 nt3□□□□□ -1.93
VFA1P40080 YOR248WYOR248W 303 nt3□□□□□ -1.93
VFA1P40080 GPI17YDR434W 1605 nt3□□□□□ -1.93
VFA1P40080 IOC3YFR013W 2364 nt3□□□□□ -1.93
VFA1P40080 TAF2YCR042C 4224 nt2.99□□□□□ -1.93
VFA1P40080 NBL1YHR199C-A 222 nt2.99□□□□□ -1.93
VFA1P40080 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.99□□□□□ -1.93
VFA1P40080 RPB11YOL005C 363 nt2.99□□□□□ -1.93
VFA1P40080 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt2.99□□□□□ -1.93
VFA1P40080 YPL039WYPL039W 951 nt2.99□□□□□ -1.93
VFA1P40080 SEN54YPL083C 1404 nt2.99□□□□□ -1.93
VFA1P40080 STT4YLR305C 5703 nt2.99□□□□□ -1.93
VFA1P40080 TIF35YDR429C 825 nt2.98□□□□□ -1.93
VFA1P40080 YMR31YFR049W 372 nt2.98□□□□□ -1.93
VFA1P40080 YIL174WYIL174W 228 nt2.98□□□□□ -1.93
VFA1P40080 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.98□□□□□ -1.93
VFA1P40080 YJR079WYJR079W 330 nt2.98□□□□□ -1.93
VFA1P40080 TEN1YLR010C 483 nt2.98□□□□□ -1.93
VFA1P40080 APC9YLR102C 798 nt2.98□□□□□ -1.93
VFA1P40080 DBP7YKR024C 2229 nt2.98□□□□□ -1.93
VFA1P40080 AXL1YPR122W 3627 nt2.98□□□□□ -1.93
VFA1P40080 ENA5YDR038C 3276 nt2.98□□□□□ -1.93
VFA1P40080 RIX1YHR197W 2292 nt2.98□□□□□ -1.93
VFA1P40080 KAP95YLR347C 2586 nt2.98□□□□□ -1.93
VFA1P40080 RPA190YOR341W 4995 nt2.97□□□□□ -1.93
VFA1P40080 BPT1YLL015W 4680 nt2.97□□□□□ -1.93
VFA1P40080 TAO3YIL129C 7131 nt2.97□□□□□ -1.93
VFA1P40080 INP52YNL106C 3552 nt2.97□□□□□ -1.93
VFA1P40080 DPB11YJL090C 2295 nt2.97□□□□□ -1.93
VFA1P40080 PEX1YKL197C 3132 nt2.97□□□□□ -1.93
VFA1P40080 TSA2YDR453C 591 nt2.97□□□□□ -1.93
VFA1P40080 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.97□□□□□ -1.93
VFA1P40080 FYV4YHR059W 393 nt2.97□□□□□ -1.93
VFA1P40080 BAT1YHR208W 1182 nt2.97□□□□□ -1.93
VFA1P40080 YML037CYML037C 1023 nt2.97□□□□□ -1.93
VFA1P40080 YPL197CYPL197C 414 nt2.97□□□□□ -1.93
VFA1P40080 SIP3YNL257C 3690 nt2.97□□□□□ -1.93
VFA1P40080 RCY1YJL204C 2523 nt2.96□□□□□ -1.93
VFA1P40080 PFK26YIL107C 2484 nt2.96□□□□□ -1.94
VFA1P40080 RNH70YGR276C 1662 nt2.96□□□□□ -1.94
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