Protein–RNA interactions for Protein: P34220

YBL055C, Deoxyribonuclease Tat-D, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL055CP34220 SVS1YPL163C 783 nt2.76□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 IKI3YLR384C 4050 nt2.76□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 FLO11YIR019C 4104 nt2.75□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 RSE1YML049C 4086 nt2.75□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt2.75□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.75□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 YIL054WYIL054W 318 nt2.75□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 RPL16AYIL133C 600 nt2.75□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 YKL044WYKL044W 321 nt2.75□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 SDO1YLR022C 753 nt2.75□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 YOL150CYOL150C 312 nt2.75□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 CAF120YNL278W 3183 nt2.75□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 SSF2YDR312W 1362 nt2.74□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 GDI1YER136W 1356 nt2.74□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 YGR018CYGR018C 330 nt2.74□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 YLR302CYLR302C 363 nt2.74□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 HHT2YNL031C 411 nt2.74□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 RUF22RUF22 515 nt2.74□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 RIO2YNL207W 1278 nt2.74□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 ATX2YOR079C 942 nt2.74□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 SPC29YPL124W 762 nt2.74□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 GIN4YDR507C 3429 nt2.74□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 RPO41YFL036W 4056 nt2.73□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 AHC2YCR082W 387 nt2.73□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 YPL034WYPL034W 498 nt2.73□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 LCL1YPL056C 306 nt2.73□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 ALG14YBR070C 714 nt2.73□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 RRG8YPR116W 834 nt2.73□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 JSN1YJR091C 3276 nt2.73□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 CWC22YGR278W 1734 nt2.73□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 UBP16YPL072W 1500 nt2.73□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 POM152YMR129W 4014 nt2.72□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 HPA3YEL066W 540 nt2.72□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 PAU23YLR037C 375 nt2.72□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 GPI15YNL038W 690 nt2.72□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.72□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 VPS64YDR200C 1815 nt2.72□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 YJL007CYJL007C 315 nt2.71□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 YJR157WYJR157W 363 nt2.71□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 PRE8YML092C 753 nt2.71□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 RPS12YOR369C 432 nt2.71□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 RRD2YPL152W 1077 nt2.71□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 HAA1YPR008W 2085 nt2.71□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 SIP3YNL257C 3690 nt2.71□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 SSN2YDR443C 4263 nt2.71□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 SNF12YNR023W 1701 nt2.71□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 UTP14YML093W 2700 nt2.7□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt2.7□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 RTR2YDR066C 591 nt2.7□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 TIM11YDR322C-A 291 nt2.7□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 YMR31YFR049W 372 nt2.7□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 YAP3YHL009C 993 nt2.7□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 YHR130CYHR130C 336 nt2.7□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 LSM2YBL026W 288 nt2.7□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 PBI2YNL015W 228 nt2.7□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 YNR021WYNR021W 1215 nt2.7□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 YPL205CYPL205C 345 nt2.7□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 YPR177CYPR177C 372 nt2.7□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 YPR203WYPR203W 309 nt2.7□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.7□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 JIP5YPR169W 1479 nt2.7□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.69□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.69□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 COX13YGL191W 390 nt2.69□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 YHC1YLR298C 696 nt2.69□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 HSP10YOR020C 321 nt2.69□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 PDR1YGL013C 3207 nt2.69□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 COG3YER157W 2406 nt2.69□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 KEL2YGR238C 2649 nt2.69□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 FUS1YCL027W 1539 nt2.68□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 YFL019CYFL019C 354 nt2.68□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 YKL066WYKL066W 444 nt2.68□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 ARV1YLR242C 966 nt2.68□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 SYM1YLR251W 594 nt2.68□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 PEP12YOR036W 867 nt2.68□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 YPL276WYPL276W 438 nt2.68□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 ARR2YPR200C 393 nt2.68□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 YBR209WYBR209W 318 nt2.68□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 ASM4YDL088C 1587 nt2.68□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 NPR1YNL183C 2373 nt2.68□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 MRD1YPR112C 2664 nt2.68□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 SPB1YCL054W 2526 nt2.67□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 YDR209CYDR209C 414 nt2.67□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 BNA7YDR428C 786 nt2.67□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 RAD6YGL058W 519 nt2.67□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 ERV1YGR029W 570 nt2.67□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 APC2YLR127C 2562 nt2.67□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 PTP3YER075C 2787 nt2.66□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 RPL29YFR032C-A 180 nt2.66□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.66□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.66□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.66□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.66□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.66□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.66□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.66□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 SPC1YJR010C-A 285 nt2.66□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 GPI14YJR013W 1212 nt2.66□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 YKL202WYKL202W 582 nt2.66□□□□□ -1.98
YBL055CP34220 YNL046WYNL046W 519 nt2.66□□□□□ -1.98
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