Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms