Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms