Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 YNR025CYNR025C 360 nt2.42□□□□□ -2.02
LDB17Q12342 RPL11AYPR102C 525 nt2.42□□□□□ -2.02
LDB17Q12342 SDC25YLL016W 3147 nt2.42□□□□□ -2.02
LDB17Q12342 PHO91YNR013C 2685 nt2.42□□□□□ -2.02
LDB17Q12342 YIL080WYIL080W 4722 nt2.42□□□□□ -2.02
LDB17Q12342 SPF1YEL031W 3648 nt2.41□□□□□ -2.02
LDB17Q12342 LST4YKL176C 2487 nt2.41□□□□□ -2.02
LDB17Q12342 YCR064CYCR064C 411 nt2.41□□□□□ -2.02
LDB17Q12342 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt2.41□□□□□ -2.02
LDB17Q12342 ERG28YER044C 447 nt2.41□□□□□ -2.02
LDB17Q12342 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.41□□□□□ -2.02
LDB17Q12342 YIL012WYIL012W 342 nt2.41□□□□□ -2.02
LDB17Q12342 ASG7YJL170C 630 nt2.41□□□□□ -2.02
LDB17Q12342 YBR051WYBR051W 351 nt2.41□□□□□ -2.02
LDB17Q12342 YPR147CYPR147C 915 nt2.41□□□□□ -2.02
LDB17Q12342 YPR153WYPR153W 423 nt2.41□□□□□ -2.02
LDB17Q12342 TAD1YGL243W 1203 nt2.4□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YJL119CYJL119C 324 nt2.4□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.4□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 BET3YKR068C 582 nt2.4□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 NYV1YLR093C 762 nt2.4□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt2.4□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YRO2YBR054W 1035 nt2.4□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 SUS1YBR111W-A 291 nt2.4□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 SEC66YBR171W 621 nt2.4□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 TMA64YDR117C 1698 nt2.4□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 TMN3YER113C 2121 nt2.39□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 MSB1YOR188W 3414 nt2.39□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 ASI3YNL008C 2031 nt2.39□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 FUS1YCL027W 1539 nt2.39□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 ROY1YMR258C 1662 nt2.39□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 KEI1YDR367W 666 nt2.39□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YGR050CYGR050C 357 nt2.39□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 AIM19YIL087C 474 nt2.39□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YAL037WYAL037W 804 nt2.39□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 PSY1YKL076C 384 nt2.39□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 ATP3YBR039W 936 nt2.39□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 ARL3YPL051W 597 nt2.39□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YPR170CYPR170C 336 nt2.39□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 snR191snR191 274 nt2.39□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YNL018CYNL018C 1839 nt2.39□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 BUB1YGR188C 3066 nt2.39□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 SLK19YOR195W 2466 nt2.39□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YEL1YBL060W 2064 nt2.38□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 OSW7YFR039C 1533 nt2.38□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 MRP10YDL045W-A 288 nt2.38□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YAP5YIR018W 738 nt2.38□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 SDS22YKL193C 1017 nt2.38□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YCT1YLL055W 1596 nt2.38□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 ERG29YMR134W 714 nt2.38□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YAP7YOL028C 738 nt2.38□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 HEM4YOR278W 828 nt2.38□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.38□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YPR014CYPR014C 330 nt2.38□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 JID1YPR061C 906 nt2.38□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 SCY1YGL083W 2415 nt2.38□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 MAL33YBR297W 1407 nt2.37□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 HOS4YIL112W 3252 nt2.37□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 STI1YOR027W 1770 nt2.37□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YRB1YDR002W 606 nt2.37□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 NTF2YER009W 378 nt2.37□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 MRP49YKL167C 414 nt2.37□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YNL046WYNL046W 519 nt2.37□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 MUD1YBR119W 897 nt2.37□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YCL007CYCL007C 393 nt2.37□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YPP1YGR198W 2454 nt2.37□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 UBP15YMR304W 3693 nt2.36□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YEF3YLR249W 3135 nt2.36□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YCR013CYCR013C 648 nt2.36□□□□□ -2.03
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LDB17Q12342 snR76snR76 109 nt2.36□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 MIC19YFR011C 513 nt2.36□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 COG2YGR120C 789 nt2.36□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YLR271WYLR271W 825 nt2.36□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 GIM5YML094W 492 nt2.36□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YMR254CYMR254C 309 nt2.36□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 ESF2YNR054C 951 nt2.36□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 UBX3YDL091C 1368 nt2.36□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.35□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YMR31YFR049W 372 nt2.35□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 MPO1YGL010W 525 nt2.35□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YJL202CYJL202C 348 nt2.35□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.35□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YJR087WYJR087W 351 nt2.35□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 RPL25YOL127W 429 nt2.35□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 PUF4YGL014W 2667 nt2.35□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 SNX41YDR425W 1878 nt2.35□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 RGL1YPL066W 1440 nt2.34□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 VTC3YPL019C 2508 nt2.34□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 NCS2YNL119W 1482 nt2.34□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 NPR3YHL023C 3441 nt2.34□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 SCD5YOR329C 2619 nt2.34□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 snR5snR5 204 nt2.34□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 PBP4YDL053C 558 nt2.34□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YFH1YDL120W 525 nt2.34□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YDR115WYDR115W 318 nt2.34□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 GET1YGL020C 708 nt2.34□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 PEX4YGR133W 552 nt2.34□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.34□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 PRP21YJL203W 843 nt2.34□□□□□ -2.03
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