Protein–RNA interactions for Protein: P47095

MDE1, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, yeastyeast

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDE1P47095 SEC66YBR171W 621 nt2.6□□□□□ -1.99
MDE1P47095 NTC20YBR188C 423 nt2.6□□□□□ -1.99
MDE1P47095 SGM1YJR134C 2124 nt2.6□□□□□ -1.99
MDE1P47095 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.6□□□□□ -1.99
MDE1P47095 PSD2YGR170W 3417 nt2.59□□□□□ -1.99
MDE1P47095 TRS130YMR218C 3309 nt2.59□□□□□ -1.99
MDE1P47095 PSK2YOL045W 3306 nt2.59□□□□□ -1.99
MDE1P47095 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.59□□□□□ -1.99
MDE1P47095 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.59□□□□□ -1.99
MDE1P47095 MIC19YFR011C 513 nt2.59□□□□□ -1.99
MDE1P47095 STE18YJR086W 333 nt2.59□□□□□ -1.99
MDE1P47095 RLP24YLR009W 600 nt2.59□□□□□ -1.99
MDE1P47095 HEM4YOR278W 828 nt2.59□□□□□ -1.99
MDE1P47095 YPR172WYPR172W 603 nt2.59□□□□□ -1.99
MDE1P47095 COG3YER157W 2406 nt2.59□□□□□ -2
MDE1P47095 CTF13YMR094W 1437 nt2.59□□□□□ -2
MDE1P47095 YNL018CYNL018C 1839 nt2.58□□□□□ -2
MDE1P47095 SIP3YNL257C 3690 nt2.58□□□□□ -2
MDE1P47095 ROY1YMR258C 1662 nt2.58□□□□□ -2
MDE1P47095 YDR115WYDR115W 318 nt2.58□□□□□ -2
MDE1P47095 NCB2YDR397C 441 nt2.58□□□□□ -2
MDE1P47095 FAR7YFR008W 666 nt2.58□□□□□ -2
MDE1P47095 SDL1YIL167W 633 nt2.58□□□□□ -2
MDE1P47095 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.58□□□□□ -2
MDE1P47095 APC9YLR102C 798 nt2.58□□□□□ -2
MDE1P47095 VPS63YLR261C 327 nt2.58□□□□□ -2
MDE1P47095 VPS20YMR077C 666 nt2.58□□□□□ -2
MDE1P47095 YDR338CYDR338C 2088 nt2.57□□□□□ -2
MDE1P47095 PHO2YDL106C 1680 nt2.57□□□□□ -2
MDE1P47095 SHS1YDL225W 1656 nt2.57□□□□□ -2
MDE1P47095 TDA2YER071C 381 nt2.57□□□□□ -2
MDE1P47095 RPL23BYER117W 414 nt2.57□□□□□ -2
MDE1P47095 YJL202CYJL202C 348 nt2.57□□□□□ -2
MDE1P47095 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt2.57□□□□□ -2
MDE1P47095 RNP1YLL046C 750 nt2.57□□□□□ -2
MDE1P47095 RPS16AYMR143W 432 nt2.57□□□□□ -2
MDE1P47095 RCN2YOR220W 798 nt2.57□□□□□ -2
MDE1P47095 MEI5YPL121C 669 nt2.57□□□□□ -2
MDE1P47095 YBR071WYBR071W 636 nt2.57□□□□□ -2
MDE1P47095 YLR001CYLR001C 2589 nt2.57□□□□□ -2
MDE1P47095 HOS4YIL112W 3252 nt2.57□□□□□ -2
MDE1P47095 PUF4YGL014W 2667 nt2.57□□□□□ -2
MDE1P47095 YKL075CYKL075C 1353 nt2.57□□□□□ -2
MDE1P47095 YJL132WYJL132W 2253 nt2.57□□□□□ -2
MDE1P47095 TPS2YDR074W 2691 nt2.56□□□□□ -2
MDE1P47095 SKP2YNL311C 2292 nt2.56□□□□□ -2
MDE1P47095 HYP2YEL034W 474 nt2.56□□□□□ -2
MDE1P47095 IST3YIR005W 447 nt2.56□□□□□ -2
MDE1P47095 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.56□□□□□ -2
MDE1P47095 NCS2YNL119W 1482 nt2.56□□□□□ -2
MDE1P47095 NPR3YHL023C 3441 nt2.56□□□□□ -2
MDE1P47095 MMS1YPR164W 4224 nt2.56□□□□□ -2
MDE1P47095 YGR050CYGR050C 357 nt2.55□□□□□ -2
MDE1P47095 ATP18YML081C-A 180 nt2.55□□□□□ -2
MDE1P47095 UTP15YMR093W 1542 nt2.55□□□□□ -2
MDE1P47095 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.55□□□□□ -2
MDE1P47095 ATG3YNR007C 933 nt2.55□□□□□ -2
MDE1P47095 ESF2YNR054C 951 nt2.55□□□□□ -2
MDE1P47095 CAT5YOR125C 702 nt2.55□□□□□ -2
MDE1P47095 RBL2YOR265W 321 nt2.55□□□□□ -2
MDE1P47095 YKR078WYKR078W 1758 nt2.54□□□□□ -2
MDE1P47095 RPO41YFL036W 4056 nt2.54□□□□□ -2
MDE1P47095 YDL016CYDL016C 303 nt2.54□□□□□ -2
MDE1P47095 YDR193WYDR193W 399 nt2.54□□□□□ -2
MDE1P47095 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.54□□□□□ -2
MDE1P47095 SLX9YGR081C 633 nt2.54□□□□□ -2
MDE1P47095 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.54□□□□□ -2
MDE1P47095 PRS3YHL011C 963 nt2.54□□□□□ -2
MDE1P47095 YIL174WYIL174W 228 nt2.54□□□□□ -2
MDE1P47095 APQ13YJL075C 417 nt2.54□□□□□ -2
MDE1P47095 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.54□□□□□ -2
MDE1P47095 ACF4YJR083C 930 nt2.54□□□□□ -2
MDE1P47095 YLR012CYLR012C 300 nt2.54□□□□□ -2
MDE1P47095 RIM9YMR063W 720 nt2.54□□□□□ -2
MDE1P47095 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.54□□□□□ -2
MDE1P47095 KTI11YBL071W-A 249 nt2.54□□□□□ -2
MDE1P47095 RPS12YOR369C 432 nt2.54□□□□□ -2
MDE1P47095 YBR062CYBR062C 543 nt2.54□□□□□ -2
MDE1P47095 NUP100YKL068W 2880 nt2.54□□□□□ -2
MDE1P47095 TMA64YDR117C 1698 nt2.53□□□□□ -2
MDE1P47095 RPN3YER021W 1572 nt2.53□□□□□ -2
MDE1P47095 SIR3YLR442C 2937 nt2.53□□□□□ -2
MDE1P47095 RGL1YPL066W 1440 nt2.53□□□□□ -2
MDE1P47095 TRA1YHR099W 11235 nt2.53□□□□□ -2
MDE1P47095 snR84snR84 550 nt2.53□□□□□ -2
MDE1P47095 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.53□□□□□ -2
MDE1P47095 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.53□□□□□ -2
MDE1P47095 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.53□□□□□ -2
MDE1P47095 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.53□□□□□ -2
MDE1P47095 ERP6YGL002W 651 nt2.53□□□□□ -2
MDE1P47095 YNL046WYNL046W 519 nt2.53□□□□□ -2
MDE1P47095 YNL150WYNL150W 408 nt2.53□□□□□ -2
MDE1P47095 SCY1YGL083W 2415 nt2.52□□□□□ -2.01
MDE1P47095 ESL2YKR096W 3588 nt2.52□□□□□ -2.01
MDE1P47095 SRO77YBL106C 3033 nt2.52□□□□□ -2.01
MDE1P47095 snR59snR59 78 nt2.52□□□□□ -2.01
MDE1P47095 MRP10YDL045W-A 288 nt2.52□□□□□ -2.01
MDE1P47095 YDL187CYDL187C 330 nt2.52□□□□□ -2.01
MDE1P47095 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.52□□□□□ -2.01
MDE1P47095 PEA2YER149C 1263 nt2.52□□□□□ -2.01
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