Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 SCY1YGL083W 2415 nt2.62□□□□□ -1.99
AVT5P38176 BUD4YJR092W 4344 nt2.62□□□□□ -1.99
AVT5P38176 SNQ2YDR011W 4506 nt2.62□□□□□ -1.99
AVT5P38176 CWH41YGL027C 2502 nt2.62□□□□□ -1.99
AVT5P38176 EMP70YLR083C 2004 nt2.61□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YJL169WYJL169W 369 nt2.61□□□□□ -1.99
AVT5P38176 RNP1YLL046C 750 nt2.61□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YMR141CYMR141C 309 nt2.61□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YPR203WYPR203W 309 nt2.61□□□□□ -1.99
AVT5P38176 SAP1YER047C 2694 nt2.61□□□□□ -1.99
AVT5P38176 EMI1YDR512C 564 nt2.6□□□□□ -1.99
AVT5P38176 CRG1YHR209W 876 nt2.6□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt2.6□□□□□ -1.99
AVT5P38176 BET3YKR068C 582 nt2.6□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YOR053WYOR053W 342 nt2.6□□□□□ -1.99
AVT5P38176 IRC16YPR038W 360 nt2.6□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YPR197CYPR197C 564 nt2.6□□□□□ -1.99
AVT5P38176 GCD6YDR211W 2139 nt2.6□□□□□ -1.99
AVT5P38176 DBF20YPR111W 1695 nt2.6□□□□□ -1.99
AVT5P38176 DNM1YLL001W 2274 nt2.59□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.59□□□□□ -1.99
AVT5P38176 DYN1YKR054C 12279 nt2.59□□□□□ -1.99
AVT5P38176 DIA2YOR080W 2199 nt2.59□□□□□ -1.99
AVT5P38176 MET10YFR030W 3108 nt2.59□□□□□ -1.99
AVT5P38176 RTR2YDR066C 591 nt2.59□□□□□ -1.99
AVT5P38176 IRC2YDR112W 309 nt2.59□□□□□ -1.99
AVT5P38176 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.59□□□□□ -1.99
AVT5P38176 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.59□□□□□ -1.99
AVT5P38176 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.59□□□□□ -1.99
AVT5P38176 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.59□□□□□ -1.99
AVT5P38176 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.59□□□□□ -1.99
AVT5P38176 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.59□□□□□ -1.99
AVT5P38176 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.59□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.59□□□□□ -1.99
AVT5P38176 PKR1YMR123W 369 nt2.59□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.59□□□□□ -1.99
AVT5P38176 BI4Q0120 1917 nt2.59□□□□□ -1.99
AVT5P38176 SSF2YDR312W 1362 nt2.59□□□□□ -2
AVT5P38176 YFR054CYFR054C 579 nt2.58□□□□□ -2
AVT5P38176 ERV1YGR029W 570 nt2.58□□□□□ -2
AVT5P38176 DFG10YIL049W 762 nt2.58□□□□□ -2
AVT5P38176 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.58□□□□□ -2
AVT5P38176 LSM8YJR022W 330 nt2.58□□□□□ -2
AVT5P38176 HIT1YJR055W 495 nt2.58□□□□□ -2
AVT5P38176 YAL037WYAL037W 804 nt2.58□□□□□ -2
AVT5P38176 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.58□□□□□ -2
AVT5P38176 CDC33YOL139C 642 nt2.58□□□□□ -2
AVT5P38176 YOR105WYOR105W 327 nt2.58□□□□□ -2
AVT5P38176 YOR199WYOR199W 330 nt2.58□□□□□ -2
AVT5P38176 YOR277CYOR277C 309 nt2.58□□□□□ -2
AVT5P38176 LCL1YPL056C 306 nt2.58□□□□□ -2
AVT5P38176 PIS1YPR113W 663 nt2.58□□□□□ -2
AVT5P38176 PSY4YBL046W 1326 nt2.58□□□□□ -2
AVT5P38176 ICR1ICR1 3199 nt2.58□□□□□ -2
AVT5P38176 AKR1YDR264C 2295 nt2.58□□□□□ -2
AVT5P38176 HOP1YIL072W 1818 nt2.58□□□□□ -2
AVT5P38176 YNR063WYNR063W 1824 nt2.58□□□□□ -2
AVT5P38176 FLO5YHR211W 3228 nt2.58□□□□□ -2
AVT5P38176 YRR1YOR162C 2433 nt2.58□□□□□ -2
AVT5P38176 SHQ1YIL104C 1524 nt2.58□□□□□ -2
AVT5P38176 STE6YKL209C 3873 nt2.57□□□□□ -2
AVT5P38176 PCK1YKR097W 1650 nt2.57□□□□□ -2
AVT5P38176 YNL193WYNL193W 1677 nt2.57□□□□□ -2
AVT5P38176 EAP1YKL204W 1899 nt2.57□□□□□ -2
AVT5P38176 YDL009CYDL009C 324 nt2.57□□□□□ -2
AVT5P38176 YDR209CYDR209C 414 nt2.57□□□□□ -2
AVT5P38176 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.57□□□□□ -2
AVT5P38176 VEL1YGL258W 621 nt2.57□□□□□ -2
AVT5P38176 AIM26YKL037W 357 nt2.57□□□□□ -2
AVT5P38176 YLR269CYLR269C 351 nt2.57□□□□□ -2
AVT5P38176 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.57□□□□□ -2
AVT5P38176 YSY6YBR162W-A 198 nt2.57□□□□□ -2
AVT5P38176 FKH2YNL068C 2589 nt2.57□□□□□ -2
AVT5P38176 TFC1YBR123C 1950 nt2.57□□□□□ -2
AVT5P38176 FLO1YAR050W 4614 nt2.57□□□□□ -2
AVT5P38176 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.57□□□□□ -2
AVT5P38176 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.57□□□□□ -2
AVT5P38176 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.57□□□□□ -2
AVT5P38176 ECM21YBL101C 3354 nt2.57□□□□□ -2
AVT5P38176 GDI1YER136W 1356 nt2.57□□□□□ -2
AVT5P38176 YTA7YGR270W 4140 nt2.57□□□□□ -2
AVT5P38176 EXO84YBR102C 2262 nt2.57□□□□□ -2
AVT5P38176 TOM70YNL121C 1854 nt2.56□□□□□ -2
AVT5P38176 YDR338CYDR338C 2088 nt2.56□□□□□ -2
AVT5P38176 NOP4YPL043W 2058 nt2.56□□□□□ -2
AVT5P38176 YGL152CYGL152C 678 nt2.56□□□□□ -2
AVT5P38176 RPS20YHL015W 366 nt2.56□□□□□ -2
AVT5P38176 SRL3YKR091W 741 nt2.56□□□□□ -2
AVT5P38176 RPS1AYLR441C 768 nt2.56□□□□□ -2
AVT5P38176 ADI1YMR009W 540 nt2.56□□□□□ -2
AVT5P38176 IMP4YNL075W 873 nt2.56□□□□□ -2
AVT5P38176 MRPL40YPL173W 894 nt2.56□□□□□ -2
AVT5P38176 ARR2YPR200C 393 nt2.56□□□□□ -2
AVT5P38176 MSH4YFL003C 2637 nt2.56□□□□□ -2
AVT5P38176 CHO2YGR157W 2610 nt2.56□□□□□ -2
AVT5P38176 STN1YDR082W 1485 nt2.56□□□□□ -2
AVT5P38176 LRG1YDL240W 3054 nt2.56□□□□□ -2
AVT5P38176 CEP3YMR168C 1827 nt2.56□□□□□ -2
AVT5P38176 YEL1YBL060W 2064 nt2.56□□□□□ -2
AVT5P38176 GPI19YDR437W 423 nt2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 50.4 ms