Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms