Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms