Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I4

PCDHAC2, Protocadherin alpha-C2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHAC2Q9Y5I4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHAC2Q9Y5I4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHAC2Q9Y5I4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHAC2Q9Y5I4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHAC2Q9Y5I4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCDHAC2Q9Y5I4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHAC2Q9Y5I4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHAC2Q9Y5I4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHAC2Q9Y5I4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHAC2Q9Y5I4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHAC2Q9Y5I4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHAC2Q9Y5I4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHAC2Q9Y5I4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHAC2Q9Y5I4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHAC2Q9Y5I4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHAC2Q9Y5I4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.9 ms