Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 HAA1YPR008W 2085 nt2.69□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 snR70snR70 164 nt2.69□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 YDL158CYDL158C 309 nt2.69□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 COX8YLR395C 237 nt2.69□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 MRPL33YMR286W 261 nt2.69□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 YNL050CYNL050C 813 nt2.69□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 YRO2YBR054W 1035 nt2.69□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 YPR014CYPR014C 330 nt2.69□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 CBP6YBR120C 489 nt2.69□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 APC2YLR127C 2562 nt2.69□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 YCT1YLL055W 1596 nt2.69□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 RTT10YPL183C 3042 nt2.68□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 YIP1YGR172C 747 nt2.68□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 MRP49YKL167C 414 nt2.68□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 SDS22YKL193C 1017 nt2.68□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 HEM4YOR278W 828 nt2.68□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 snR43snR43 209 nt2.68□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 UBX3YDL091C 1368 nt2.68□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 PTP3YER075C 2787 nt2.68□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 NPR3YHL023C 3441 nt2.68□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 UTP15YMR093W 1542 nt2.68□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 ESC1YMR219W 4977 nt2.67□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 APM3YBR288C 1452 nt2.67□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 YCR090CYCR090C 549 nt2.67□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 PBP4YDL053C 558 nt2.67□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 YHR213WYHR213W 597 nt2.67□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 YKL066WYKL066W 444 nt2.67□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 YAR062WYAR062W 597 nt2.67□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 CWC24YLR323C 780 nt2.67□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 SFM1YOR021C 642 nt2.67□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 SGT1YOR057W 1188 nt2.67□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 PIS1YPR113W 663 nt2.67□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 PDR1YGL013C 3207 nt2.67□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 NEW1YPL226W 3591 nt2.67□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 SCY1YGL083W 2415 nt2.67□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 CYR1YJL005W 6081 nt2.66□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 TRM2YKR056W 1920 nt2.66□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 FIR1YER032W 2631 nt2.66□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 GIN4YDR507C 3429 nt2.66□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 MFB1YDR219C 1398 nt2.66□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 YKL075CYKL075C 1353 nt2.66□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 MND1YGL183C 660 nt2.66□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.66□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 SYS1YJL004C 612 nt2.66□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 YJL086CYJL086C 369 nt2.66□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 YAL037WYAL037W 804 nt2.66□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 SUL1YBR294W 2580 nt2.65□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 GCV2YMR189W 3105 nt2.65□□□□□ -1.98
VPS54Q12071 ICR1ICR1 3199 nt2.65□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 RPO41YFL036W 4056 nt2.65□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt2.65□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 YIL082WYIL082W 873 nt2.65□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt2.65□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 YJL147CYJL147C 1149 nt2.65□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 RPS16AYMR143W 432 nt2.65□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.65□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 GIM3YNL153C 390 nt2.65□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 YBR063CYBR063C 1215 nt2.65□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 ALY1YKR021W 2748 nt2.65□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 TOP2YNL088W 4287 nt2.65□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 FUS1YCL027W 1539 nt2.64□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 YDR250CYDR250C 276 nt2.64□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.64□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 NOP19YGR251W 591 nt2.64□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.64□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 PDR3YBL005W 2931 nt2.64□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 YDR239CYDR239C 2364 nt2.64□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 YLR001CYLR001C 2589 nt2.63□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 FKS3YMR306W 5358 nt2.63□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 NUM1YDR150W 8247 nt2.63□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 YCR099CYCR099C 468 nt2.63□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 GPI19YDR437W 423 nt2.63□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 EMC6YLL014W 327 nt2.63□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 IRC21YMR073C 606 nt2.63□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 YPR170CYPR170C 336 nt2.63□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.63□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 YLR108CYLR108C 1458 nt2.63□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 RLI1YDR091C 1827 nt2.63□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 BFR1YOR198C 1413 nt2.62□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.62□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 TRA1YHR099W 11235 nt2.62□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 FAR7YFR008W 666 nt2.62□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 YOR050CYOR050C 348 nt2.62□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.62□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 RLF2YPR018W 1821 nt2.62□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 SRO77YBL106C 3033 nt2.62□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 SPB1YCL054W 2526 nt2.62□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 TRS130YMR218C 3309 nt2.62□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 YBT1YLL048C 4986 nt2.61□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 YDR186CYDR186C 2634 nt2.61□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 GCD10YNL062C 1437 nt2.61□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 NCS2YNL119W 1482 nt2.61□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 RCN1YKL159C 636 nt2.61□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 YOL134CYOL134C 390 nt2.61□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 YCL007CYCL007C 393 nt2.61□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 KAR9YPL269W 1935 nt2.6□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 COG3YER157W 2406 nt2.6□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 YDL163WYDL163W 303 nt2.6□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 RPS26BYER131W 360 nt2.6□□□□□ -1.99
VPS54Q12071 MST27YGL051W 705 nt2.6□□□□□ -1.99
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