Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00271P0C7V0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms