Protein–RNA interactions for Protein: Q9P107

GMIP, GEM-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMIPQ9P107 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GMIPQ9P107 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms