Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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