Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRC63Q05C16 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms