Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	YJL119C	YJL119C	324 nt		2.79	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	LSM8	YJR022W	330 nt		2.79	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	TDA8	YAL064C-A	381 nt		2.79	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	YAR062W	YAR062W	597 nt		2.79	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	INP1	YMR204C	1263 nt		2.79	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	YMR254C	YMR254C	309 nt		2.79	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	YOR385W	YOR385W	873 nt		2.79	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	LOA1	YPR139C	903 nt		2.79	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	KHA1	YJL094C	2622 nt		2.79	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	RTT10	YPL183C	3042 nt		2.79	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	15S_rRNA	15S_rRNA	1649 nt		2.79	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	POL3	YDL102W	3294 nt		2.78	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	RGR1	YLR071C	3249 nt		2.78	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	YER091C-A	YER091C-A	222 nt		2.78	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	MTM1	YGR257C	1101 nt		2.78	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	YIL174W	YIL174W	228 nt		2.78	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	YJL222W-A	YJL222W-A	228 nt		2.78	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	SRP21	YKL122C	504 nt		2.78	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	YLR257W	YLR257W	966 nt		2.78	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	GYP7	YDL234C	2241 nt		2.78	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	SMY2	YBR172C	2223 nt		2.78	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	MED1	YPR070W	1701 nt		2.78	□□□□□ -1.96
DSL1	P53847	TRA1	YHR099W	11235 nt		2.78	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	NCS2	YNL119W	1482 nt		2.77	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	AVT2	YEL064C	1443 nt		2.77	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YKL075C	YKL075C	1353 nt		2.77	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	SGM1	YJR134C	2124 nt		2.77	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YGR067C	YGR067C	2415 nt		2.77	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YNL193W	YNL193W	1677 nt		2.77	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	snR9	snR9	187 nt		2.77	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	DAD1	YDR016C	285 nt		2.77	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	VMA21	YGR105W	234 nt		2.77	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YIR020C-B	YIR020C-B	735 nt		2.77	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	BUD19	YJL188C	309 nt		2.77	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	RPL33A	YPL143W	324 nt		2.77	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	CSM4	YPL200W	471 nt		2.77	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	SWD3	YBR175W	948 nt		2.77	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YCK2	YNL154C	1641 nt		2.77	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YKL222C	YKL222C	2118 nt		2.77	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YDR210W-A	YDR210W-A	1317 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	PSY4	YBL046W	1326 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YDR018C	YDR018C	1191 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YDR115W	YDR115W	318 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	EMC4	YGL231C	573 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YGR109W-A	YGR109W-A	873 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YGR293C	YGR293C	462 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YIL082W	YIL082W	873 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YAP5	YIR018W	738 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YKR033C	YKR033C	426 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	MSN1	YOL116W	1149 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YPR050C	YPR050C	414 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	ILS1	YBL076C	3219 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	UTP15	YMR093W	1542 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YOR296W	YOR296W	3870 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	MAL33	YBR297W	1407 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	SKO1	YNL167C	1944 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	TOP2	YNL088W	4287 nt		2.75	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	SRO77	YBL106C	3033 nt		2.75	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	TLC1	TLC1	1301 nt		2.75	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YLR446W	YLR446W	1302 nt		2.75	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	TDA2	YER071C	381 nt		2.75	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YGL159W	YGL159W	1113 nt		2.75	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YIR036W-A	YIR036W-A	402 nt		2.75	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	ACF4	YJR083C	930 nt		2.75	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	CWC24	YLR323C	780 nt		2.75	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YNL203C	YNL203C	612 nt		2.75	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YAP7	YOL028C	738 nt		2.75	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YBR062C	YBR062C	543 nt		2.75	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	MSH4	YFL003C	2637 nt		2.75	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	NEL1	YHR035W	1893 nt		2.75	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	FAA2	YER015W	2235 nt		2.74	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	EAP1	YKL204W	1899 nt		2.74	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	NCB2	YDR397C	441 nt		2.74	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	AST2	YER101C	1293 nt		2.74	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YGR053C	YGR053C	852 nt		2.74	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YJL086C	YJL086C	369 nt		2.74	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	SMA2	YML066C	1110 nt		2.74	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	RPS16A	YMR143W	432 nt		2.74	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	KTI11	YBL071W-A	249 nt		2.74	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	MEI5	YPL121C	669 nt		2.74	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	PIS1	YPR113W	663 nt		2.74	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	KEL2	YGR238C	2649 nt		2.74	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	ORC2	YBR060C	1863 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	PHO2	YDL106C	1680 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	PAM1	YDR251W	2493 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	snR59	snR59	78 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YCR090C	YCR090C	549 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	CRD1	YDL142C	852 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YDR029W	YDR029W	315 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	SDL1	YIL167W	633 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	STE18	YJR086W	333 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YKL023C-A	YKL023C-A	228 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	MCR1	YKL150W	909 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	COX8	YLR395C	237 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	GMC2	YLR445W	567 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	ATP18	YML081C-A	180 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YMR194C-A	YMR194C-A	225 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	TPK2	YPL203W	1143 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	BCK1	YJL095W	4437 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	TMA64	YDR117C	1698 nt		2.73	□□□□□ -1.97

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