Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PHKA1P46020 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms