Protein–RNA interactions for Protein: P40073

SHO1, High osmolarity signaling protein SHO1, yeastyeast

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHO1P40073 YDR442WYDR442W 393 nt2.79□□□□□ -1.96
SHO1P40073 PUG1YER185W 912 nt2.79□□□□□ -1.96
SHO1P40073 RPB9YGL070C 369 nt2.79□□□□□ -1.96
SHO1P40073 RPS21AYKR057W 264 nt2.79□□□□□ -1.96
SHO1P40073 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.79□□□□□ -1.96
SHO1P40073 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.79□□□□□ -1.96
SHO1P40073 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.79□□□□□ -1.96
SHO1P40073 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.79□□□□□ -1.96
SHO1P40073 BER1YLR412W 825 nt2.79□□□□□ -1.96
SHO1P40073 YMR144WYMR144W 1029 nt2.79□□□□□ -1.96
SHO1P40073 RPL16BYNL069C 597 nt2.79□□□□□ -1.96
SHO1P40073 CHA4YLR098C 1947 nt2.79□□□□□ -1.96
SHO1P40073 SNT1YCR033W 3681 nt2.79□□□□□ -1.96
SHO1P40073 YMR317WYMR317W 3423 nt2.78□□□□□ -1.96
SHO1P40073 RRM3YHR031C 2172 nt2.78□□□□□ -1.96
SHO1P40073 VTC4YJL012C 2166 nt2.78□□□□□ -1.96
SHO1P40073 UTP15YMR093W 1542 nt2.78□□□□□ -1.96
SHO1P40073 RGL1YPL066W 1440 nt2.78□□□□□ -1.96
SHO1P40073 VPS74YDR372C 1038 nt2.78□□□□□ -1.96
SHO1P40073 YER165C-AYER165C-A 357 nt2.78□□□□□ -1.96
SHO1P40073 YJL007CYJL007C 315 nt2.78□□□□□ -1.96
SHO1P40073 YJL086CYJL086C 369 nt2.78□□□□□ -1.96
SHO1P40073 ENV10YLR065C 546 nt2.78□□□□□ -1.96
SHO1P40073 PDP3YLR455W 915 nt2.78□□□□□ -1.96
SHO1P40073 UNG1YML021C 1080 nt2.78□□□□□ -1.96
SHO1P40073 PHO80YOL001W 882 nt2.78□□□□□ -1.96
SHO1P40073 YBR062CYBR062C 543 nt2.78□□□□□ -1.96
SHO1P40073 NTC20YBR188C 423 nt2.78□□□□□ -1.96
SHO1P40073 NTO1YPR031W 2247 nt2.78□□□□□ -1.96
SHO1P40073 BNI4YNL233W 2679 nt2.78□□□□□ -1.96
SHO1P40073 BMS1YPL217C 3552 nt2.78□□□□□ -1.96
SHO1P40073 FRE8YLR047C 2061 nt2.78□□□□□ -1.96
SHO1P40073 CHS3YBR023C 3498 nt2.77□□□□□ -1.97
SHO1P40073 SCY1YGL083W 2415 nt2.77□□□□□ -1.97
SHO1P40073 YNL193WYNL193W 1677 nt2.77□□□□□ -1.97
SHO1P40073 VMA8YEL051W 771 nt2.77□□□□□ -1.97
SHO1P40073 ADI1YMR009W 540 nt2.77□□□□□ -1.97
SHO1P40073 YPL142CYPL142C 318 nt2.77□□□□□ -1.97
SHO1P40073 MRPL40YPL173W 894 nt2.77□□□□□ -1.97
SHO1P40073 YPL205CYPL205C 345 nt2.77□□□□□ -1.97
SHO1P40073 CBP2YHL038C 1893 nt2.77□□□□□ -1.97
SHO1P40073 HFM1YGL251C 3564 nt2.77□□□□□ -1.97
SHO1P40073 DIA2YOR080W 2199 nt2.77□□□□□ -1.97
SHO1P40073 SNU56YDR240C 1479 nt2.77□□□□□ -1.97
SHO1P40073 NDT80YHR124W 1884 nt2.76□□□□□ -1.97
SHO1P40073 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.76□□□□□ -1.97
SHO1P40073 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.76□□□□□ -1.97
SHO1P40073 RSR1YGR152C 819 nt2.76□□□□□ -1.97
SHO1P40073 YIR020CYIR020C 303 nt2.76□□□□□ -1.97
SHO1P40073 YLR252WYLR252W 306 nt2.76□□□□□ -1.97
SHO1P40073 CWC24YLR323C 780 nt2.76□□□□□ -1.97
SHO1P40073 DSF2YBR007C 2211 nt2.75□□□□□ -1.97
SHO1P40073 YDR537CYDR537C 606 nt2.75□□□□□ -1.97
SHO1P40073 RPS21BYJL136C 264 nt2.75□□□□□ -1.97
SHO1P40073 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt2.75□□□□□ -1.97
SHO1P40073 ATX2YOR079C 942 nt2.75□□□□□ -1.97
SHO1P40073 YOR331CYOR331C 558 nt2.75□□□□□ -1.97
SHO1P40073 PIS1YPR113W 663 nt2.75□□□□□ -1.97
SHO1P40073 AIM4YBR194W 372 nt2.75□□□□□ -1.97
SHO1P40073 ARP4YJL081C 1470 nt2.75□□□□□ -1.97
SHO1P40073 KAR9YPL269W 1935 nt2.75□□□□□ -1.97
SHO1P40073 RGC1YPR115W 3252 nt2.75□□□□□ -1.97
SHO1P40073 PCK1YKR097W 1650 nt2.75□□□□□ -1.97
SHO1P40073 EAP1YKL204W 1899 nt2.75□□□□□ -1.97
SHO1P40073 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.74□□□□□ -1.97
SHO1P40073 CWH41YGL027C 2502 nt2.74□□□□□ -1.97
SHO1P40073 TMA64YDR117C 1698 nt2.74□□□□□ -1.97
SHO1P40073 CCT7YJL111W 1653 nt2.74□□□□□ -1.97
SHO1P40073 BTT1YDR252W 450 nt2.74□□□□□ -1.97
SHO1P40073 RPL30YGL030W 318 nt2.74□□□□□ -1.97
SHO1P40073 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt2.74□□□□□ -1.97
SHO1P40073 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.74□□□□□ -1.97
SHO1P40073 VPS51YKR020W 495 nt2.74□□□□□ -1.97
SHO1P40073 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt2.74□□□□□ -1.97
SHO1P40073 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.74□□□□□ -1.97
SHO1P40073 TIM12YBR091C 330 nt2.74□□□□□ -1.97
SHO1P40073 DAL5YJR152W 1632 nt2.74□□□□□ -1.97
SHO1P40073 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.74□□□□□ -1.97
SHO1P40073 EPL1YFL024C 2499 nt2.74□□□□□ -1.97
SHO1P40073 FUN30YAL019W 3396 nt2.74□□□□□ -1.97
SHO1P40073 MSH4YFL003C 2637 nt2.73□□□□□ -1.97
SHO1P40073 TOM70YNL121C 1854 nt2.73□□□□□ -1.97
SHO1P40073 PCI8YIL071C 1335 nt2.73□□□□□ -1.97
SHO1P40073 BUD4YJR092W 4344 nt2.73□□□□□ -1.97
SHO1P40073 MIX14YDR031W 366 nt2.73□□□□□ -1.97
SHO1P40073 IRC2YDR112W 309 nt2.73□□□□□ -1.97
SHO1P40073 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.73□□□□□ -1.97
SHO1P40073 YGR053CYGR053C 852 nt2.73□□□□□ -1.97
SHO1P40073 YJL169WYJL169W 369 nt2.73□□□□□ -1.97
SHO1P40073 SYM1YLR251W 594 nt2.73□□□□□ -1.97
SHO1P40073 COX8YLR395C 237 nt2.73□□□□□ -1.97
SHO1P40073 EXO84YBR102C 2262 nt2.73□□□□□ -1.97
SHO1P40073 MAL33YBR297W 1407 nt2.73□□□□□ -1.97
SHO1P40073 YDR338CYDR338C 2088 nt2.73□□□□□ -1.97
SHO1P40073 ASM4YDL088C 1587 nt2.73□□□□□ -1.97
SHO1P40073 HOP1YIL072W 1818 nt2.72□□□□□ -1.97
SHO1P40073 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.72□□□□□ -1.97
SHO1P40073 RPL9AYGL147C 576 nt2.72□□□□□ -1.97
SHO1P40073 YGR042WYGR042W 816 nt2.72□□□□□ -1.97
SHO1P40073 RPL16AYIL133C 600 nt2.72□□□□□ -1.97
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