Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00271P0C7V0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms