Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY65

NPCDR1, Nasopharyngeal carcinoma down-regulated gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPCDR1Q9BY65 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPCDR1Q9BY65 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPCDR1Q9BY65 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPCDR1Q9BY65 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPCDR1Q9BY65 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPCDR1Q9BY65 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms