Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSPG4P5Q96PW8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSPG4P5Q96PW8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms